265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1867 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 308 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  68.52 
 
 		 320 aa  381  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  64.9 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.57 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  67.55 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  69.08 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  62.87 
 
 		 316 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  61.97 
 
 		 318 aa  348  8e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  61.25 
 
 		 284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  63.05 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  43.77 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  42.03 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  42.03 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  42.03 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  41.84 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  43.34 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  41.16 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  42.42 
 
 		 297 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  43.73 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.89 
 
 		 286 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  42.66 
 
 		 299 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  42.66 
 
 		 299 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  42.66 
 
 		 299 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  42.18 
 
 		 336 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.84 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.66 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  41.52 
 
 		 299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  42.57 
 
 		 317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  42.36 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 		 286 aa  119  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.26 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  34.26 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  27.12 
 
 		 306 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.79 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.01 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.01 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1083  putative integral membrane protein  42.96 
 
 		 143 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0682285  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0791  multidrug ABC transporter permease  42.96 
 
 		 143 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.92484  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.85 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.9 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  27.76 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  29.13 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  26.6 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  30.3 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  28.96 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  35.84 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  28.34 
 
 		 310 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  28.96 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  28.67 
 
 		 331 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  28.67 
 
 		 331 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  30.1 
 
 		 296 aa  89  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  25.34 
 
 		 304 aa  89  9e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  29.1 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  29.29 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.21 
 
 		 320 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  41.22 
 
 		 154 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  41.22 
 
 		 154 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  29.77 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.3 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  30.36 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  28.82 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  28.71 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  32.27 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2387  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000106611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  32.74 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  31.82 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.85 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  28.83 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  27.74 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  28.19 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  28.47 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.16 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  29.9 
 
 		 236 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  29.92 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  25.2 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  20.56 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  22.44 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  25.19 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.32 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  26.72 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  27.52 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  27.95 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  24.22 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.97 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  32.88 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  29.41 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  29.41 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  29.41 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1205  hypothetical protein  30.8 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  26.22 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.99 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.36 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  22.54 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  20.21 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  22.41 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3416  hypothetical protein  36.56 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>