More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1473 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
300 aa  591  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.65 
 
 
355 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2387  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.05 
 
 
303 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000106611  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  39.72 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.48 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  37.5 
 
 
296 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  41.28 
 
 
300 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  40.74 
 
 
301 aa  192  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  43.45 
 
 
330 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  43.07 
 
 
301 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.5 
 
 
301 aa  186  4e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  43.07 
 
 
301 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.01 
 
 
330 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0478  hypothetical protein  41.94 
 
 
322 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1205  hypothetical protein  33.09 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.79 
 
 
283 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 
315 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  28.94 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  30.2 
 
 
302 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  29.77 
 
 
302 aa  85.5  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  28.62 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  27.94 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  29.18 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  24.83 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  26.87 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.3 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.83 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  28.37 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  27.86 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  27.86 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  31.23 
 
 
336 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  28.63 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  27.86 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.22 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  27.21 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.89 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  28.57 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  25.75 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  25.42 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.51 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  23.97 
 
 
287 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.79 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  26.04 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  27.46 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  24.83 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  27.18 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  24.83 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  26.53 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.57 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  24.5 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  25.91 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  23.31 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  26.74 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  26.64 
 
 
314 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  27.03 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  22.3 
 
 
287 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  27.03 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  21.55 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  27.03 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  23.42 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 
313 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 
292 aa  63.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.8 
 
 
292 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  23.49 
 
 
294 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  24.22 
 
 
291 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 
335 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.93 
 
 
306 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  22.9 
 
 
306 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  23.15 
 
 
294 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  23.15 
 
 
294 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  24.32 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  25.09 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  22.43 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  28.35 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  25.65 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  25.63 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  22.3 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  25.2 
 
 
284 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  25.26 
 
 
305 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  26.25 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  29.21 
 
 
330 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  25.97 
 
 
303 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 
325 aa  60.1  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  24.29 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  25.76 
 
 
318 aa  59.3  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  25.6 
 
 
286 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  32.84 
 
 
307 aa  59.3  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  23.59 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.51 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4228  drug/metabolite exporter family protein  23.47 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  23.59 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>