More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_924 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  100 
 
 		 287 aa  558  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  93.38 
 
 		 287 aa  511  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  89.55 
 
 		 287 aa  483  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  49.3 
 
 		 291 aa  292  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  44.28 
 
 		 303 aa  248  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  46.09 
 
 		 303 aa  248  8e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  43.54 
 
 		 303 aa  244  9e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  43.73 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  43.73 
 
 		 304 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  43.73 
 
 		 304 aa  239  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  43.73 
 
 		 304 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  45.31 
 
 		 304 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  44.53 
 
 		 304 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0112  hypothetical protein  48.56 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2709  EamA family protein  44.11 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00270641  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.73 
 
 		 294 aa  182  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.4 
 
 		 301 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.77 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  38.77 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  38.77 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  38.77 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  38.41 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0094  hypothetical protein  32.74 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  36.21 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0098  hypothetical protein  32.74 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  35.9 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  34.84 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  35.77 
 
 		 314 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6058  hypothetical protein  36.59 
 
 		 298 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5832  hypothetical protein  36.96 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.684234 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.09 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.503688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  33.82 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4101  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.08 
 
 		 309 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0391  hypothetical protein  33.95 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  32.29 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 335 aa  122  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182068 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  29.58 
 
 		 296 aa  119  7.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  31.94 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  31.69 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  28.04 
 
 		 312 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  27.95 
 
 		 305 aa  95.9  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2821  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.86 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.499218  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  27.3 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.01 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  27.08 
 
 		 303 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 		 292 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  28.62 
 
 		 303 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  28.12 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  28.12 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 312 aa  89  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  28.28 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  27.78 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  29.54 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  28.28 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 		 325 aa  86.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  29.07 
 
 		 341 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.83 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 286 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  27.43 
 
 		 303 aa  85.9  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  27.43 
 
 		 303 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  27.08 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  27.53 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  31.27 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  27.62 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  23.18 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  25.9 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  25.9 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  25.9 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  26.92 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  25.9 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.19 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  25.9 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  26.6 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  26.43 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1849  hypothetical protein  28.45 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1521  hypothetical protein  27.2 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.851073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  26.87 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  29.2 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  27.27 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  26.74 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  28.52 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.84 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  25.1 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  25.1 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  28.02 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  28.02 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  28.02 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  25.09 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.06 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4598  hypothetical protein  24.3 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  28.09 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>