More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6058 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6058  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5832  hypothetical protein  97.31 
 
 		 298 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.684234 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  88.63 
 
 		 299 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  88.63 
 
 		 299 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  88.63 
 
 		 299 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  86.96 
 
 		 299 aa  461  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.79 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.503688 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  48.49 
 
 		 314 aa  241  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.02 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.36 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  40.5 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  37.5 
 
 		 303 aa  175  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  37.5 
 
 		 303 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  38.43 
 
 		 304 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  38.43 
 
 		 303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  38.04 
 
 		 304 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  38.04 
 
 		 304 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  38.04 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0112  hypothetical protein  43 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  36.56 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  36.86 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  36.59 
 
 		 287 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  37.65 
 
 		 304 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  38.04 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0094  hypothetical protein  32.09 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0098  hypothetical protein  32.09 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2709  EamA family protein  38.04 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00270641  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  33.21 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 294 aa  119  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  35.62 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  31.19 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  32.6 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  31.05 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4101  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.25 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  30.04 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0391  hypothetical protein  32.35 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.16 
 
 		 340 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  33.21 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.79 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.87 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.03 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  29.82 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  28.26 
 
 		 312 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.99 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2821  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.62 
 
 		 342 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.499218  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  27.3 
 
 		 304 aa  89.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  26.91 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  28.78 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  27.54 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  28.78 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  32.97 
 
 		 328 aa  86.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  30.37 
 
 		 319 aa  85.9  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  30.72 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  26.45 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  26.45 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  26.45 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  26.81 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  30.43 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  26.18 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.78 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  26.09 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  26.09 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  30.71 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25.7 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  26.09 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  29.67 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1521  hypothetical protein  26.04 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.851073  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  29.14 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  31.32 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  30.77 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  32.54 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  25 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  28.86 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  31.97 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  25.91 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  29.58 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  29.92 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  27.76 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  25.76 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  31.54 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  29.52 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  31.88 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  33.57 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  28.86 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  31.54 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  31.54 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  28.05 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  29.86 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  28.05 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4598  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  24.24 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>