More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2821 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2821  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 342 aa  653    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.499218  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  51.79 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  45.2 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.32 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  47.33 
 
 		 327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  45.95 
 
 		 312 aa  219  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0391  hypothetical protein  46.39 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.85 
 
 		 340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.76 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  29.93 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  30.26 
 
 		 303 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  35.02 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  30.4 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  30.4 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  30.4 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.84 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  31.5 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  31.5 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  30.04 
 
 		 304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  29.67 
 
 		 304 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.71 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0112  hypothetical protein  35.79 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  31.6 
 
 		 287 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2709  EamA family protein  29.24 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00270641  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  31.23 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  30.86 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  33.44 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  31.94 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0094  hypothetical protein  28.52 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0098  hypothetical protein  28.52 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6058  hypothetical protein  33.11 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5832  hypothetical protein  32.25 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.684234 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  30.93 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 		 295 aa  94.4  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.503688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4101  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.51 
 
 		 309 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  29.9 
 
 		 314 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.74 
 
 		 294 aa  89.7  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  26.64 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  26.64 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  26.64 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  26.64 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  26.64 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  26.64 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.88 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.48 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  23.4 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  25.12 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  25.12 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  25.12 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.04 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  25.12 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  25.12 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  25.12 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  24.65 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.65 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  26.5 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.06 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.14 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  20.07 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  26.58 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  28.62 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.86 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  29.39 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  24.13 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  23.89 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  25.78 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  22.6 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  29.11 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  23.81 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0316  hypothetical protein  28.15 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.238675  normal  0.667988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  28.33 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.83 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.23 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  30.1 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  28.9 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  23.89 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  27.06 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  26.61 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  24.13 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.3 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.9 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  30.9 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  24.57 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  26.61 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25.91 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  28.22 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  27.49 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.83 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  26.23 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  27.38 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  25.63 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.12 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>