More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1001 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  608  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  98.95 
 
 		 286 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  88.51 
 
 		 307 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.72 
 
 		 293 aa  202  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  37.58 
 
 		 301 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.49 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.14 
 
 		 301 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  40.45 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  40.07 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  36.58 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  39.93 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  37.67 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.46 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.58 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  39.25 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  36.13 
 
 		 426 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  38.6 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  38.81 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  38.46 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  36.09 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.96 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  36.09 
 
 		 376 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  35.76 
 
 		 312 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  35.12 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  35.96 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  36.01 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  36.3 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  35.79 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  35.79 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  35.79 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  35.12 
 
 		 311 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  31.85 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  36.3 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  34.13 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  33.45 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  36.59 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  32.08 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  32.08 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  32.08 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  34.98 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  36.16 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  34.98 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  31.88 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  33.82 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  32.65 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  34.17 
 
 		 314 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  36.13 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  29.22 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  29.22 
 
 		 314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  32.12 
 
 		 313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  31.29 
 
 		 312 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  28.11 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  31.21 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  31.21 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  31.21 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  31.21 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  31.21 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  30.63 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  31.21 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  30.63 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  30.63 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  30.14 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2852  hypothetical protein  27.87 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  31.18 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.28 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  26.4 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0609  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.74 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  25.98 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  28.37 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  28.37 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  28.67 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  28.01 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  27.7 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  28.47 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  29.18 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4695  hypothetical protein  28.15 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  28.93 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.69 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  33.7 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.7 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  33.7 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  33.7 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  33.7 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  27.46 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  27.4 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  24.41 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  25.96 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  33.7 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  33.7 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  33.7 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  24.44 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  33.7 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3051  hypothetical protein  26.37 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  27.4 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  24.75 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  28.72 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>