More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4430 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  100 
 
 		 304 aa  592  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  98.03 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  98.03 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  98.03 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  98.03 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  97.7 
 
 		 301 aa  573  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  98.03 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  98.03 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  98.03 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.23 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  46.59 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1754  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.74 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.59 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  39.85 
 
 		 305 aa  152  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.4 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.413764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  30.15 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  29.45 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2852  hypothetical protein  29.28 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  28.62 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  30.58 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  28.57 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3051  hypothetical protein  28.99 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  27.96 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  30.43 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  28.06 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  30.43 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  31.05 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4236  putative transport protein  29.15 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172586  normal  0.870652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  30.07 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1688  hypothetical protein  30.47 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  28.4 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2007  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  33.15 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  33.7 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  30.36 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  28.45 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  27.95 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  31.49 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  25.99 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.9 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  24.5 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.71 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  30.47 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.03 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  27.93 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  22.78 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  31.18 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  26.64 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  26.15 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  27.36 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  34.17 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.57 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.95 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.51 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  25.09 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  24.01 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0172  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  28.87 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  30.05 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  25.75 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  29.77 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  23.4 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0825  hypothetical protein  27.59 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  27.37 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.01 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.02 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4618  hypothetical protein  29.95 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  30.98 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  27.37 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3614  integral membrane protein  28.08 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  31.52 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.91 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  43.84 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  26.64 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  25.67 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  30.98 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  28.08 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.36 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  32.16 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1660  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  26.67 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  25.91 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  30.98 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  31.65 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  27.03 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  30 
 
 		 343 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  25.95 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  29.38 
 
 		 297 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.74 
 
 		 304 aa  53.5  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 356 aa  53.1  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  28.29 
 
 		 289 aa  52.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 		 335 aa  52.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.79 
 
 		 291 aa  52.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  27.69 
 
 		 300 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>