More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3260 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  83.5 
 
 		 297 aa  477  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  70.79 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.83 
 
 		 295 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.81 
 
 		 295 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.39 
 
 		 293 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  63.73 
 
 		 321 aa  338  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  64.97 
 
 		 294 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  62.71 
 
 		 293 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  62.71 
 
 		 292 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  65.28 
 
 		 293 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  62.71 
 
 		 293 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  62.37 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  62.5 
 
 		 294 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  62.5 
 
 		 294 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  62.15 
 
 		 294 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  62.15 
 
 		 294 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  62.15 
 
 		 294 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  62.15 
 
 		 294 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  63.55 
 
 		 300 aa  315  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  62.03 
 
 		 322 aa  314  9e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  62.03 
 
 		 293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  59.18 
 
 		 326 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  59.18 
 
 		 294 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  58.5 
 
 		 294 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  63.79 
 
 		 297 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  59.18 
 
 		 295 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  57.14 
 
 		 303 aa  286  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.41 
 
 		 300 aa  272  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  54.33 
 
 		 299 aa  272  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  53.63 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.92 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  52.92 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  52.92 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  52.92 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  52.92 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  52.92 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  52.58 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  50.85 
 
 		 311 aa  252  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  54.67 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  54.67 
 
 		 300 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  54.67 
 
 		 299 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  54.67 
 
 		 299 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  54.67 
 
 		 300 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  45.08 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.94 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  46.94 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  46.76 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  47.52 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  47.2 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  39.35 
 
 		 296 aa  199  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  39.35 
 
 		 296 aa  198  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.14 
 
 		 306 aa  192  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  40.89 
 
 		 307 aa  188  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  35.12 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  40 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  44.86 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.11 
 
 		 324 aa  186  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  43.6 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  42.49 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.05 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  35.84 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  42.5 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  44.75 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  44.16 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  45.99 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.5 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  43.23 
 
 		 365 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  34.68 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2380  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.21 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6025  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.82 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  43.89 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  36.09 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  35.98 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  45.08 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  41.97 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  39.93 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5501  hypothetical protein  46.95 
 
 		 297 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  35.22 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3249  hypothetical protein  35.15 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538989  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.15 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0911  hypothetical protein  32.38 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1376  hypothetical protein  32.89 
 
 		 318 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  33.1 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  34.72 
 
 		 301 aa  105  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  32.42 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3681  hypothetical protein  27.44 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  29.2 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  31.22 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  28.11 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  27.87 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  27.31 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  27.76 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  29.77 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  28.52 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  28.52 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.5 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  28.14 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  25.53 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>