More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4560 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  595  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2007  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.81 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1688  hypothetical protein  38.91 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.01 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.413764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  38.46 
 
 		 334 aa  165  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2363  hypothetical protein  31.74 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.847183  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  30.94 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.84 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  31.64 
 
 		 305 aa  93.2  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02797  hypothetical protein  29.32 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.605573  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  29.63 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  29.46 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.46 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  31.32 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1754  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  31.13 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  31.5 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.5 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  24.92 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  25.08 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  24.4 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.25 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  27.66 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.53 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  28.8 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.8 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  28.8 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  23.53 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  28.8 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  28.8 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  28.8 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  28.8 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  23.53 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  23.53 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  23.53 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  32.66 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  23.53 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  26.91 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  28.4 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  29.43 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  28.4 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.51 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  27.24 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  27.57 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.3 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2852  hypothetical protein  24.71 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.93 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  27.97 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  27.97 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  27.97 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  29.72 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  28.47 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  24.2 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3051  hypothetical protein  23.71 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0825  hypothetical protein  29.13 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  29.03 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  26.28 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  34.81 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  26.28 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.12 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  30.73 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  24.63 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  29.13 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  35.77 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  24.91 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  28.98 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  27.34 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  25.53 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  25.87 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  25.87 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4236  putative transport protein  27.17 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172586  normal  0.870652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.65 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  34.09 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  25.54 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4695  hypothetical protein  28.46 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  21.4 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  26.35 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  25.87 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  26.26 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  25.87 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  25.61 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  25.87 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.21 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  25.87 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  25.76 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  25.76 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  25.78 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  25.76 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  25.76 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  25.76 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>