More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0661 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  677    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  72.97 
 
 
324 aa  428  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.46 
 
 
293 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  41.89 
 
 
311 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  41.91 
 
 
343 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  44.95 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  41.54 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  41.54 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  41.54 
 
 
292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  42.28 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  45.32 
 
 
316 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  42.75 
 
 
299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.45 
 
 
299 aa  196  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  41.54 
 
 
321 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.6 
 
 
299 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  42.6 
 
 
299 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  42.6 
 
 
299 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  42.6 
 
 
299 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  42.6 
 
 
299 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  42.6 
 
 
299 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  42.24 
 
 
299 aa  192  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  42.24 
 
 
299 aa  192  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  41.91 
 
 
294 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  39.3 
 
 
296 aa  190  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  39.63 
 
 
296 aa  189  8e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  41.91 
 
 
294 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  41.91 
 
 
294 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  38.38 
 
 
326 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  38.38 
 
 
294 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6025  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.38 
 
 
319 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32908  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  38.05 
 
 
294 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.72 
 
 
306 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  41.91 
 
 
294 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  41.91 
 
 
294 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  41.91 
 
 
294 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  41.91 
 
 
294 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  41.91 
 
 
322 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  45.02 
 
 
305 aa  186  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  38.72 
 
 
295 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  41.91 
 
 
293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  43.12 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  42.91 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  42.25 
 
 
293 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  42.19 
 
 
314 aa  183  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.89 
 
 
324 aa  179  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  40.2 
 
 
297 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  40.94 
 
 
308 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  44.11 
 
 
305 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.29 
 
 
295 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  42.47 
 
 
300 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  41.04 
 
 
303 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  42.47 
 
 
300 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  42.47 
 
 
300 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  42.47 
 
 
299 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  42.47 
 
 
299 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.93 
 
 
295 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  39.3 
 
 
298 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  35.61 
 
 
304 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  41.72 
 
 
300 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  39.65 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2380  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.44 
 
 
324 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  40.26 
 
 
300 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  38.52 
 
 
306 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  41.54 
 
 
301 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.16 
 
 
306 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  39.93 
 
 
303 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  37.41 
 
 
311 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.14 
 
 
300 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  34.63 
 
 
298 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  37.04 
 
 
298 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  35.62 
 
 
312 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  35.8 
 
 
300 aa  142  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1376  hypothetical protein  35.26 
 
 
318 aa  142  9e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  40.07 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  41.53 
 
 
297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  30.39 
 
 
294 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  31.71 
 
 
298 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  32.37 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5501  hypothetical protein  41.14 
 
 
297 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3249  hypothetical protein  34.58 
 
 
290 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538989  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.49 
 
 
300 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  31.54 
 
 
273 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0911  hypothetical protein  31.91 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  32.29 
 
 
291 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  34.74 
 
 
303 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  32.11 
 
 
301 aa  84  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3681  hypothetical protein  31.4 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  27.65 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  27.92 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  39.86 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.71 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  32.66 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  36.36 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  26.85 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  27.24 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  24.91 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  31.79 
 
 
311 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  29.18 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  28.71 
 
 
414 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 
302 aa  63.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>