More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1754 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1754  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 322 aa  616  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  38.64 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  38.31 
 
 		 301 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.31 
 
 		 301 aa  209  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  38.31 
 
 		 301 aa  209  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  38.31 
 
 		 301 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  38.31 
 
 		 301 aa  209  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  38.31 
 
 		 301 aa  209  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  39.64 
 
 		 301 aa  208  9e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  38.18 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.49 
 
 		 293 aa  200  3e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.16 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  44.09 
 
 		 305 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  38.67 
 
 		 305 aa  153  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.53 
 
 		 300 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.413764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  29.78 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  27.04 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  28.08 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  28.9 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  29.59 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.66 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.3 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  28.37 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  31.96 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  29.37 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.18 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  30.42 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  28.32 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  28.1 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.41 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  24.29 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  29.6 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  26.18 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3051  hypothetical protein  26.01 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  26.97 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  31.37 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.18 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.45 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  23.76 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  25.45 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  25.45 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  25.45 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  25.45 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2567  hypothetical protein  29.55 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  25.45 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  26.22 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  31.98 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  26.76 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2852  hypothetical protein  26.6 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  28.45 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  28.28 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  29.23 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  25.09 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  30.14 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  27.72 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02797  hypothetical protein  27.54 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.605573  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4236  putative transport protein  31.67 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172586  normal  0.870652 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  27.48 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  25 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  27.48 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  25.18 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  25.18 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  26.16 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  24.56 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  25.18 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2007  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  25.18 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  27.24 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  28.87 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  25.18 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  24.14 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1688  hypothetical protein  29.27 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  27.21 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  26.47 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  25.95 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  28.62 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  30.19 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  27.72 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.97 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  28.81 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  27.12 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  27.59 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  23.46 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  26.73 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  26.73 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.5 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  29.3 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>