274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8212 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 303 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  46.76 
 
 		 299 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  43.66 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  45.58 
 
 		 299 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  43.66 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.23 
 
 		 299 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  47.35 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4236  putative transport protein  45.21 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172586  normal  0.870652 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  29.92 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4618  hypothetical protein  31.97 
 
 		 298 aa  99.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 296 aa  95.9  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3051  hypothetical protein  29.24 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2852  hypothetical protein  30.28 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0825  hypothetical protein  29.1 
 
 		 283 aa  86.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  27.5 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4695  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  25.56 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2007  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  25.98 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  27.24 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1688  hypothetical protein  29.68 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  27.78 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  23.91 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  29.41 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  28.5 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  27.78 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  27.78 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  27.78 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  32.14 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  27.78 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  27.78 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  31.34 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  27.78 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  25.62 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.78 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  25.62 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.78 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.83 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.413764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  29.39 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  27.04 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  25.1 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  31.05 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1754  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.57 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.01 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  29.07 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  27.24 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  32.34 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  27.43 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.8 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  26.55 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  26.88 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  26.98 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0663  hypothetical protein  30.58 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.467844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3083  hypothetical protein  30.58 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1407  integral membrane protein  30.58 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.9 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1535  integral membrane protein  30.58 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.55 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1402  integral membrane protein  30.58 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0489  hypothetical protein  30.58 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  30.56 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1203  hypothetical protein  30.58 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0889205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  28.18 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  32.86 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  28.18 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  26.88 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  28.18 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  28.18 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  28.18 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  28.18 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  32.72 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  32.72 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  25.83 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  28.18 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.2 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.98 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  28.18 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  25.9 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  26.46 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  25.64 
 
 		 321 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.64 
 
 		 301 aa  53.5  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 		 349 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  28.06 
 
 		 335 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  27.24 
 
 		 305 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>