More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1098 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  588  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.36 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  41.7 
 
 		 305 aa  188  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  40.94 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.94 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  40.94 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  40.94 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  40.94 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  40.94 
 
 		 301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  40.94 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  40.94 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  40.3 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1754  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.37 
 
 		 322 aa  156  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  32.16 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  31.32 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  30.61 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.25 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  30.97 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  29.84 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  29.23 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  28.47 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  30.77 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  30.08 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  32.47 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  29.89 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  24.58 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.92 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.86 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3051  hypothetical protein  27.84 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.11 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  31.91 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2852  hypothetical protein  28.52 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4236  putative transport protein  28.46 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172586  normal  0.870652 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  28.01 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  30.34 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  29.89 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3249  hypothetical protein  29.24 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538989  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  28.27 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  29.12 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.64 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  26.37 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.84 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  28.7 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  26.84 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0315  hypothetical protein  25 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  28.42 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25.54 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  26.47 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  26.47 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  26.47 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  26.47 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  26.47 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  25.09 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  28.07 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  28.07 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  26.76 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.28 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  26.64 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  27.34 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  26.76 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1688  hypothetical protein  28.87 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  31.86 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  25.09 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  27.65 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  29.02 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  26.15 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  26.98 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  34.42 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  28.07 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  26.71 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  26.71 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  26.71 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  28.07 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  29.76 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  25.98 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  26.71 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  26.71 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.6 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  28.07 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  28.07 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.71 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  28.92 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  26.12 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4695  hypothetical protein  27.74 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2007  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  27.15 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  27.15 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  27.15 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  27.15 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  29.73 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  26.71 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.37 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  25.09 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  27.15 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>