145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3249 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3249  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538989  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  76.9 
 
 		 300 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  75.95 
 
 		 291 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  39.3 
 
 		 297 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  34.81 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  32.99 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  32.17 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  35.44 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  34.74 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  34.74 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  33.8 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  33.8 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  34.74 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  34.04 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  34.39 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  38.11 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.4 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  34.97 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  34.97 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.11 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  34.97 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  33.45 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  33.45 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  33.45 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  33.45 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  35.17 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  34.93 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  29.74 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.4 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.6 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  29.37 
 
 		 296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  34.95 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  35.42 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  32 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  32.86 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  34.74 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  33.57 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  34.74 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  32.07 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  34.23 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6025  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.88 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  33.93 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  34.58 
 
 		 365 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  30.5 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  30.14 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  30.14 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  30.14 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  30.14 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  30.14 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  30.64 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  30.64 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  30.64 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  30.15 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  30.64 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  30.64 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  29.58 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  27.95 
 
 		 303 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5501  hypothetical protein  41.99 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  40.43 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  33.95 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  27.5 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  32.97 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  31.23 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  29.48 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  31.07 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.29 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.49 
 
 		 306 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  29.17 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  31.99 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  31.72 
 
 		 305 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  31.14 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  33.57 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  26.43 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  29.29 
 
 		 312 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2380  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.74 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  29.81 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1376  hypothetical protein  28.76 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0911  hypothetical protein  27.21 
 
 		 303 aa  85.5  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  25.09 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  31.45 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  27.59 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  28.62 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  25.33 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2567  hypothetical protein  27.4 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  29.1 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  21.24 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  30.58 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  27.11 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  25.91 
 
 		 311 aa  52.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  25.91 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  29.63 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  28.43 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  23.53 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  25.58 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  26.92 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>