More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_63190 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5501  hypothetical protein  94.28 
 
 
297 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.24 
 
 
299 aa  248  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  47.5 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  47.1 
 
 
343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  46.74 
 
 
321 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.45 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  45.14 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  45.14 
 
 
326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  45.14 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  45.83 
 
 
295 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  45.65 
 
 
292 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  45.62 
 
 
294 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  45.62 
 
 
294 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  45.65 
 
 
293 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  45.65 
 
 
293 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  43.27 
 
 
293 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  45.26 
 
 
294 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  45.26 
 
 
294 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  45.26 
 
 
294 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  45.26 
 
 
294 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  48.58 
 
 
297 aa  202  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  40.56 
 
 
296 aa  201  8e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  46.37 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.8 
 
 
295 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  41.4 
 
 
296 aa  198  9e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  44.57 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  44.64 
 
 
300 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  44.8 
 
 
297 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  43.77 
 
 
308 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  45.65 
 
 
322 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.36 
 
 
324 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  45.65 
 
 
293 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.09 
 
 
295 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  45.45 
 
 
305 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  38.1 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  43.18 
 
 
365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  42.56 
 
 
298 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  42.56 
 
 
314 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  44.84 
 
 
305 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  44.4 
 
 
306 aa  178  9e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.45 
 
 
306 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  38.68 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  39.85 
 
 
299 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  39.02 
 
 
303 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2380  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.66 
 
 
324 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  41.76 
 
 
298 aa  166  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  40.45 
 
 
316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6025  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.3 
 
 
319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32908  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.93 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.68 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  34.24 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  36.08 
 
 
307 aa  162  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  38.6 
 
 
299 aa  162  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.97 
 
 
299 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  38.97 
 
 
299 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  38.97 
 
 
299 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  38.97 
 
 
299 aa  162  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  38.97 
 
 
299 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  38.97 
 
 
299 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  42.91 
 
 
310 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  38.97 
 
 
299 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  40.29 
 
 
303 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  43.21 
 
 
301 aa  155  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3249  hypothetical protein  40 
 
 
290 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538989  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.72 
 
 
300 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  41.79 
 
 
300 aa  152  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  40.14 
 
 
291 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  33.22 
 
 
298 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  42.24 
 
 
300 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  36.04 
 
 
312 aa  145  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  39.53 
 
 
299 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  39.53 
 
 
299 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  39.53 
 
 
300 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  39.53 
 
 
300 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  39.53 
 
 
300 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.54 
 
 
300 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1376  hypothetical protein  33.22 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  32.27 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  34.7 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  30.33 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  37.62 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  37.01 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  31.5 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  30.62 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0911  hypothetical protein  32.7 
 
 
303 aa  95.5  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  29.5 
 
 
288 aa  92  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  31.54 
 
 
298 aa  89.7  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  29.61 
 
 
304 aa  87.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3681  hypothetical protein  29.41 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.770543 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  29.63 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  29.63 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  29.63 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  29.63 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  29.63 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  30.65 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  30.27 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  29.29 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>