196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3681 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3681  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  581  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  39.8 
 
 
304 aa  203  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  35.56 
 
 
288 aa  165  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  30.82 
 
 
298 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  31.18 
 
 
301 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  27.18 
 
 
303 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  27.6 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  28.1 
 
 
298 aa  85.5  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  31.06 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.51 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  28.24 
 
 
316 aa  82.4  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  27.82 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  31.4 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  27.4 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  27.24 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  27.24 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  27.24 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  28.91 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  25.96 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  27.08 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  25.61 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  25.61 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  30 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  23.63 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  26.32 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  26.32 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.83 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  27.4 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  24.22 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  26.15 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  28.69 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  23.77 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.4 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.76 
 
 
367 aa  69.7  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  28.06 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  28.06 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  28.85 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  25.18 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  26.03 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  27.78 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  27.65 
 
 
293 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  27.49 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  26.95 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  25.68 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  25.68 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  25.68 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  25.68 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  25.68 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  29.39 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 
299 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  25.68 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  27.67 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.14 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  27.67 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  27.67 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  27.67 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  28.81 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  29.48 
 
 
298 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  26.48 
 
 
311 aa  63.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  26.24 
 
 
300 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  24.83 
 
 
299 aa  62.4  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 
348 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  25.34 
 
 
301 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  28.79 
 
 
306 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.15 
 
 
306 aa  58.9  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  25.45 
 
 
312 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  25.45 
 
 
376 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  25.45 
 
 
312 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.36 
 
 
311 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  29.45 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  26.89 
 
 
319 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  25.45 
 
 
426 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  26.85 
 
 
299 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  26.95 
 
 
300 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  26.85 
 
 
299 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  26.85 
 
 
300 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  26.95 
 
 
300 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0911  hypothetical protein  25.61 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  26.1 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  22.87 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  23.33 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  22.26 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  25.09 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  22.66 
 
 
312 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  21.84 
 
 
301 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  24.39 
 
 
301 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  29.11 
 
 
299 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  29.11 
 
 
299 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  23.4 
 
 
330 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  24.74 
 
 
341 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.45 
 
 
331 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  23.64 
 
 
294 aa  52.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  26.01 
 
 
303 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>