More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0519 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  580  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  90.03 
 
 		 301 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  89.7 
 
 		 301 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  70.9 
 
 		 301 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  69.8 
 
 		 301 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  64.03 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.36 
 
 		 311 aa  325  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  59.93 
 
 		 426 aa  322  7e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  59.6 
 
 		 376 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  59.6 
 
 		 312 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  59.27 
 
 		 312 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  61.49 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  61 
 
 		 311 aa  298  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  60.6 
 
 		 311 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  60.6 
 
 		 311 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  60.6 
 
 		 311 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  54.3 
 
 		 303 aa  294  9e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  53.95 
 
 		 303 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  60.98 
 
 		 311 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  53.61 
 
 		 308 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  53.61 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  53.77 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  53.26 
 
 		 308 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  61.09 
 
 		 272 aa  255  8e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  61.09 
 
 		 272 aa  255  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  54.79 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  48.64 
 
 		 321 aa  251  7e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  50.51 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  54.09 
 
 		 308 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  51.55 
 
 		 314 aa  244  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  47.95 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  45.15 
 
 		 304 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  48.17 
 
 		 315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.46 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  47.84 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  52.43 
 
 		 302 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.14 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.21 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  44.52 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  43.14 
 
 		 317 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  41.64 
 
 		 307 aa  211  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  45.96 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  46.83 
 
 		 324 aa  198  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  48.68 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  37.58 
 
 		 307 aa  195  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  38.57 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  42.76 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  42.43 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  37.01 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  37 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  40.55 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.23 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0375  hypothetical protein  30.14 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00512602  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0609  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.47 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  28.81 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  28.17 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  30.28 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  28.48 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  28.47 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  26.69 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1850  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.61 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  26.9 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  24.63 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2616  hypothetical protein  27.09 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  29.43 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  23.68 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  25.09 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  28.32 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4847  transporter, EamA family  24.64 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  27.6 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12940  membrane protein  25.25 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000993304  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0398  hypothetical protein  23.22 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  24.06 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.97 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  26.09 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  27.34 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  28.16 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0476  transporter, EamA family  25.19 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  28.87 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.56 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  28.49 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  26.06 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  28.67 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  29.6 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  26.04 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0525  EamA family protein  24.44 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.86 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  26.81 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  26.81 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  26.81 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  31.01 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  26.81 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3681  hypothetical protein  25.34 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0456  transporter, EamA family  24.06 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>