More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3898 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 300 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  64.63 
 
 		 303 aa  347  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  60.87 
 
 		 299 aa  321  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.48 
 
 		 299 aa  317  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  63.21 
 
 		 300 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  63.21 
 
 		 300 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  63.21 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  63.21 
 
 		 300 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  63.21 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  60.14 
 
 		 299 aa  316  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  60.14 
 
 		 299 aa  315  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  60.14 
 
 		 299 aa  315  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  60.14 
 
 		 299 aa  315  5e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  59.79 
 
 		 299 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  59.79 
 
 		 299 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  59.86 
 
 		 299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.08 
 
 		 295 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.42 
 
 		 295 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  56.01 
 
 		 297 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  55.41 
 
 		 297 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.36 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  54.61 
 
 		 294 aa  285  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  55.67 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  55.67 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  55.44 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  54.98 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  56.01 
 
 		 295 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  53.08 
 
 		 293 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  51.88 
 
 		 294 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  51.88 
 
 		 294 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  51.54 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  51.54 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  51.54 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  51.54 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  51.03 
 
 		 343 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  55.03 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  50.68 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  50.68 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  50.68 
 
 		 293 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  50.68 
 
 		 292 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  53.98 
 
 		 300 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  50.85 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  50.85 
 
 		 293 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  49.32 
 
 		 311 aa  245  8e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  43 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  41.81 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  42.91 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.57 
 
 		 306 aa  199  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.92 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2380  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.1 
 
 		 324 aa  186  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.62 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  41.08 
 
 		 293 aa  179  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  36.43 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  36.07 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  40.96 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  40.07 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  40 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  39.93 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.88 
 
 		 299 aa  168  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  37.1 
 
 		 311 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  41.13 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.06 
 
 		 324 aa  165  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  38.74 
 
 		 298 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  40.99 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6025  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.73 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  38.11 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  40.48 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  32.99 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  35.56 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  32.78 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  32.67 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  37.82 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1376  hypothetical protein  32.69 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  32.06 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  37.09 
 
 		 313 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  32.08 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.3 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0911  hypothetical protein  30.13 
 
 		 303 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  34.36 
 
 		 291 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  31.5 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  31.54 
 
 		 273 aa  122  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  36.99 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  36.27 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3249  hypothetical protein  31.67 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538989  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5501  hypothetical protein  39.37 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  32.03 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  31.54 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  29.96 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  28.42 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3681  hypothetical protein  26.12 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  27.8 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  25.18 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  28.03 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2567  hypothetical protein  27.08 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  28.03 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.93 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  29.45 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  28.03 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  28.03 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.98 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>