246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3391 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  100 
 
 		 300 aa  580  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  65.14 
 
 		 298 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  53.08 
 
 		 294 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  53.33 
 
 		 273 aa  301  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0911  hypothetical protein  51.84 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  41.95 
 
 		 304 aa  242  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.5 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  41.06 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  38.49 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  36.92 
 
 		 300 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  35.97 
 
 		 293 aa  175  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  36.71 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  36.3 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  34.88 
 
 		 297 aa  168  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  36.3 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  34.13 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  34.13 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  35.48 
 
 		 298 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  34.47 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.75 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  34.26 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  34.26 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  34.03 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  34.03 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.75 
 
 		 295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  33.56 
 
 		 321 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  34.83 
 
 		 294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  34.03 
 
 		 294 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  34.03 
 
 		 294 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  34.03 
 
 		 294 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  34.03 
 
 		 294 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  34.26 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  35.71 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  33.56 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  34.01 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  35.23 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  35.71 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  34.19 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  33.56 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  33.56 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.1 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  35 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  32.78 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  33.72 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  34.04 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  32.28 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  33.81 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  34.07 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.54 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  32.54 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  32.88 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  32.88 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  32.88 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  32.54 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  35.8 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  32.88 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  30.98 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  31.86 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.77 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  34.27 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  35.37 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.92 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  30.3 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  29.93 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  33.1 
 
 		 300 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  33.1 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  33.1 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  30.82 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  33.1 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  33.1 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  30.23 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  30.39 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1376  hypothetical protein  31.09 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6025  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3249  hypothetical protein  29.9 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538989  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  34.47 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.51 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  26.41 
 
 		 291 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2380  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.5 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  30.07 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  30.27 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5501  hypothetical protein  31.38 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  26.51 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2567  hypothetical protein  28 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  27.27 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  25.93 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4228  drug/metabolite exporter family protein  24.83 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  27.55 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  25.26 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4883  transporter, EamA family  25.68 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  25.76 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  31.58 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3681  hypothetical protein  24.76 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  26.74 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  27.01 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  26.07 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>