199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0354 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  55.52 
 
 		 298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  54.52 
 
 		 310 aa  291  8e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  56.45 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  51.54 
 
 		 300 aa  256  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  50.38 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  42.03 
 
 		 305 aa  210  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  38.62 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  37.29 
 
 		 326 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.89 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  43.12 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  38.28 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  41.3 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  41.3 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  37.33 
 
 		 296 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  41.3 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  38.28 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  38.71 
 
 		 293 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  38.94 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  41.58 
 
 		 297 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  39.86 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  35.38 
 
 		 296 aa  185  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  40 
 
 		 294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  40 
 
 		 294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  39.64 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  39.64 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  39.64 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  39.64 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  39.78 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  38.71 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  34.93 
 
 		 304 aa  178  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  35.52 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  35.81 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  40.58 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  40.58 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.1 
 
 		 299 aa  172  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  35.92 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  38.2 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  39.43 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.2 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  36.52 
 
 		 308 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.48 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  34.12 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.62 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  32.3 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  36.96 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  36.88 
 
 		 297 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.47 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  34.07 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  34.07 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  33.8 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  34.43 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  34.43 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  34.43 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  34.43 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  34.43 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.07 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  33.45 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.27 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  33.7 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  35.82 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  30.27 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  34.88 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.05 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  32.44 
 
 		 365 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.78 
 
 		 300 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  29.35 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  35.74 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  32.84 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  37.45 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  35.4 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  35.4 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  35.4 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  35.4 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  35.4 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1376  hypothetical protein  29.7 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  36.08 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6025  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.39 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2380  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.42 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0911  hypothetical protein  32.25 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5501  hypothetical protein  34.8 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.18 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3249  hypothetical protein  29.17 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538989  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  29.76 
 
 		 301 aa  99.4  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  26.18 
 
 		 303 aa  89  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  27.68 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  24.36 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3681  hypothetical protein  23.77 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  25.66 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  25.82 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  25.94 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  26.49 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  27.57 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.19 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.3 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.89 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  29.14 
 
 		 279 aa  52.4  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  23.42 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  23.03 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>