278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2380 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2380  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
324 aa  612  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.4 
 
 
306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.29 
 
 
324 aa  288  7e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  55.47 
 
 
316 aa  277  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  54.58 
 
 
314 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  47.33 
 
 
343 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  46.67 
 
 
294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.4 
 
 
293 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  46.32 
 
 
326 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  46.32 
 
 
294 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  46.26 
 
 
321 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  44.14 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  46.62 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  46.62 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  44.48 
 
 
293 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  45.55 
 
 
294 aa  211  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  46.26 
 
 
294 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  46.26 
 
 
294 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  46.26 
 
 
294 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  46.26 
 
 
294 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  44.84 
 
 
293 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  44.84 
 
 
293 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  44.84 
 
 
292 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  44.6 
 
 
300 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  47.06 
 
 
297 aa  205  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  41.32 
 
 
299 aa  202  8e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  45.91 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  45.91 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  43.38 
 
 
295 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  43.1 
 
 
297 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  43.11 
 
 
308 aa  192  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.1 
 
 
300 aa  192  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  37.72 
 
 
299 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.72 
 
 
299 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  37.76 
 
 
299 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  37.72 
 
 
299 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  37.76 
 
 
299 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  37.72 
 
 
299 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.83 
 
 
324 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  42.07 
 
 
311 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  38.11 
 
 
299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  37.76 
 
 
299 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.46 
 
 
295 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  44.41 
 
 
297 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.11 
 
 
295 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  44.44 
 
 
365 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  40.73 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  41.36 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  40.73 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  41.36 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  40.4 
 
 
300 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  35.69 
 
 
298 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  37.62 
 
 
311 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.46 
 
 
299 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  41.67 
 
 
305 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6025  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.83 
 
 
319 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32908  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  33 
 
 
296 aa  159  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  37.84 
 
 
293 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.53 
 
 
306 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  40.53 
 
 
306 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  42.03 
 
 
303 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  33.33 
 
 
296 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1376  hypothetical protein  31.95 
 
 
318 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  32.05 
 
 
312 aa  151  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  35.31 
 
 
307 aa  144  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  36.21 
 
 
298 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  37.63 
 
 
305 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  38.99 
 
 
298 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  43.66 
 
 
297 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  40.57 
 
 
300 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  37.19 
 
 
310 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  28.42 
 
 
304 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  37.97 
 
 
301 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5501  hypothetical protein  44.11 
 
 
297 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  37.07 
 
 
313 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  34.9 
 
 
303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  30.2 
 
 
298 aa  119  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  36.51 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3249  hypothetical protein  34.74 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538989  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  30.53 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  24.91 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.44 
 
 
300 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  34.14 
 
 
291 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  32.67 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0911  hypothetical protein  28.68 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  25.27 
 
 
273 aa  94  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  26.07 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  28.38 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3681  hypothetical protein  27.96 
 
 
297 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  24.91 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  29.17 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.86 
 
 
367 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  25.61 
 
 
294 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  29.9 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  29.9 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  29.9 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  29.9 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  29.58 
 
 
395 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  27.3 
 
 
286 aa  60.5  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  28.07 
 
 
298 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>