More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2872 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  624  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  557  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  98.3 
 
 		 294 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  93.88 
 
 		 295 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.17 
 
 		 293 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  65.87 
 
 		 293 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  61.33 
 
 		 321 aa  348  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  59.55 
 
 		 343 aa  346  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  62.67 
 
 		 293 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  63.7 
 
 		 294 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  62.67 
 
 		 293 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  63.7 
 
 		 294 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  62.67 
 
 		 292 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  64.38 
 
 		 294 aa  342  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  68.03 
 
 		 297 aa  341  8e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  63.36 
 
 		 294 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  63.36 
 
 		 294 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  63.36 
 
 		 294 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  63.36 
 
 		 294 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  65.19 
 
 		 300 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.89 
 
 		 295 aa  338  7e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.89 
 
 		 295 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  61.59 
 
 		 322 aa  328  9e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  62.67 
 
 		 293 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  61.07 
 
 		 308 aa  325  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  59.38 
 
 		 297 aa  316  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  58.84 
 
 		 297 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  50.16 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  51.7 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  51.03 
 
 		 299 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  51.39 
 
 		 299 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.33 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  51.03 
 
 		 299 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.03 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  51.03 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  51.03 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  51.03 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  51.03 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  51.03 
 
 		 299 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  52.03 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  52.03 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  52.03 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  52.03 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  45.49 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  51.69 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  45.33 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  43 
 
 		 298 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  38.25 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  38.6 
 
 		 296 aa  213  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  46.69 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  43.33 
 
 		 306 aa  205  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.76 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  42.51 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.06 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  42.01 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  43.14 
 
 		 298 aa  199  5e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.61 
 
 		 299 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2380  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.32 
 
 		 324 aa  195  8.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  37.29 
 
 		 307 aa  195  8.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.44 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.45 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  39.25 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6025  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.99 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  40.97 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  39.8 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  39.54 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  40.89 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  43.07 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  40.14 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  35.96 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  38.49 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  32.87 
 
 		 304 aa  165  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  31.79 
 
 		 294 aa  162  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  35.74 
 
 		 300 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  35.37 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  42.05 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  44.98 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1376  hypothetical protein  31.68 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5501  hypothetical protein  45.33 
 
 		 297 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  30.74 
 
 		 273 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.68 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3249  hypothetical protein  34.97 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538989  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0911  hypothetical protein  33.45 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  34.75 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  36.46 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  30.93 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  31.07 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  30.62 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3681  hypothetical protein  25.61 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  30.47 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.76 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  27.6 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  24.66 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  30.96 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.96 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  30.96 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  30.96 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  30.43 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  30.96 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>