More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36480 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  100 
 
 		 316 aa  611  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.22 
 
 		 324 aa  298  8e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  55.89 
 
 		 314 aa  297  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.27 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2380  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.21 
 
 		 324 aa  252  6e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.84 
 
 		 293 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  41.02 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  40.4 
 
 		 326 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  40.4 
 
 		 294 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  41.88 
 
 		 293 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  42.67 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.95 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  41.58 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  41.58 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.58 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  42 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  42 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  41.58 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  42.5 
 
 		 365 aa  199  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  42 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  43.32 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  43.68 
 
 		 294 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  43.68 
 
 		 294 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  39.73 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  43.32 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  43.32 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  43.32 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  43.32 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  44.19 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  41.51 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  41.51 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  42.28 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  41.69 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  41.51 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  42.28 
 
 		 300 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  41.16 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  42.24 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  37.7 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.79 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.44 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  37.87 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  42.24 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  42.24 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.67 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  38.16 
 
 		 308 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  40.41 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  38.75 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  42.51 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  41.33 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  41.33 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  41.33 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  41.33 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  41.33 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  39.59 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  37.62 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  34.11 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  34.11 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  38.36 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6025  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.87 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  36 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.97 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  32.14 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  37.65 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  36.61 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  31.92 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.86 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  38.01 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  35.76 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  36.96 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  32.75 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1376  hypothetical protein  30.67 
 
 		 318 aa  135  9e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  30.61 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  29.62 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  36.92 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  30.3 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  37.63 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  36.84 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  37.16 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5501  hypothetical protein  36.52 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  29.37 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  32.03 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  29.62 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3249  hypothetical protein  29.89 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538989  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.31 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  30.82 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0911  hypothetical protein  28.62 
 
 		 303 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3681  hypothetical protein  27.86 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  25.81 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.36 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.76 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  26.84 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  26.35 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  25.86 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  23.65 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.55 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.19 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  25.52 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  29.86 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  23.95 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  25.59 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>