274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1085 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  100 
 
 
312 aa  606  9.999999999999999e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1376  hypothetical protein  90.25 
 
 
318 aa  557  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  36.97 
 
 
296 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  37.29 
 
 
296 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  40.2 
 
 
305 aa  182  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  35.69 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.35 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.18 
 
 
299 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  35.35 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  36.7 
 
 
321 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  36.63 
 
 
311 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  35.37 
 
 
326 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  35.37 
 
 
294 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  35.35 
 
 
343 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  35.69 
 
 
293 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  35.69 
 
 
294 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  35.69 
 
 
293 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  35.69 
 
 
292 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  34.74 
 
 
299 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.72 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  34.34 
 
 
294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  34.34 
 
 
294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.57 
 
 
324 aa  155  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  34.34 
 
 
294 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  34.34 
 
 
294 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  34.34 
 
 
294 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  34.34 
 
 
294 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  37.71 
 
 
297 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  35.79 
 
 
297 aa  152  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  35.42 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.44 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  33.44 
 
 
299 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  33.44 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  33.44 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  33.44 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  33.44 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.62 
 
 
295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  33.33 
 
 
303 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  33.11 
 
 
299 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  36.33 
 
 
300 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  35.69 
 
 
295 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  35.31 
 
 
305 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  32.89 
 
 
299 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  33.9 
 
 
298 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.11 
 
 
295 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  34.59 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  34.34 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  36.75 
 
 
365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  32.89 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.33 
 
 
306 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  33.77 
 
 
308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  34.58 
 
 
310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  34.23 
 
 
322 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  32.56 
 
 
293 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  34.23 
 
 
293 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6025  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.9 
 
 
319 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32908  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.87 
 
 
324 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  32.78 
 
 
311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  32.86 
 
 
316 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  29.35 
 
 
307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  30.85 
 
 
313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 
300 aa  126  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  31.4 
 
 
298 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  36.89 
 
 
300 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  36.89 
 
 
300 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  36.89 
 
 
300 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  36.89 
 
 
299 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  36.89 
 
 
299 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  30.7 
 
 
298 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  31.54 
 
 
304 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2380  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.56 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  33.77 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  33.89 
 
 
301 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  29.55 
 
 
303 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  33.67 
 
 
300 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  29.63 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  36.04 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.76 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  31.19 
 
 
314 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  28.15 
 
 
294 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5501  hypothetical protein  34.74 
 
 
297 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0911  hypothetical protein  29.11 
 
 
303 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3249  hypothetical protein  29.29 
 
 
290 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538989  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  26.62 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  28.52 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  26.89 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  23.1 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2567  hypothetical protein  27.91 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  24.43 
 
 
316 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  24.24 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  25.31 
 
 
330 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  24.84 
 
 
330 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0398  hypothetical protein  23.6 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  24.83 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  27.76 
 
 
314 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2616  hypothetical protein  27.69 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  24.49 
 
 
296 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  23.47 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  23.47 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>