More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1953 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  99.32 
 
 
293 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  96.25 
 
 
321 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  92.83 
 
 
343 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  93.86 
 
 
322 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  93.52 
 
 
293 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  81.91 
 
 
294 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  82.88 
 
 
294 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  81.91 
 
 
294 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  81.57 
 
 
294 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  81.57 
 
 
294 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  81.57 
 
 
294 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  81.57 
 
 
294 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  73.45 
 
 
293 aa  427  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  74.48 
 
 
293 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  74.83 
 
 
300 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  62.67 
 
 
326 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  62.67 
 
 
294 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  62.67 
 
 
294 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.19 
 
 
295 aa  348  8e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  63.85 
 
 
308 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.51 
 
 
295 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  63.01 
 
 
295 aa  341  7e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  67.13 
 
 
297 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  63.19 
 
 
297 aa  337  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  61.69 
 
 
297 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  53.82 
 
 
299 aa  275  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  51.74 
 
 
299 aa  271  7e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  51.04 
 
 
299 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  51.04 
 
 
299 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  51.04 
 
 
299 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  51.04 
 
 
299 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  51.04 
 
 
299 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.69 
 
 
299 aa  266  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  51.04 
 
 
299 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  52.03 
 
 
303 aa  261  8e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  49.83 
 
 
311 aa  258  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  52.6 
 
 
300 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  52.6 
 
 
300 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  52.6 
 
 
300 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  52.43 
 
 
299 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  52.43 
 
 
299 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  46.76 
 
 
298 aa  246  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.66 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.11 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  48.11 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  47.59 
 
 
303 aa  232  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  46.37 
 
 
298 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  41.85 
 
 
296 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  41.48 
 
 
296 aa  226  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  46.62 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.65 
 
 
299 aa  208  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  41.81 
 
 
293 aa  208  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  43.7 
 
 
298 aa  204  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  35.99 
 
 
304 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.72 
 
 
324 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.05 
 
 
306 aa  202  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  41.32 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  46.04 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.69 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  41.67 
 
 
311 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6025  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.32 
 
 
319 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32908  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  45.2 
 
 
300 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  41.51 
 
 
365 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  41.35 
 
 
316 aa  188  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  43.97 
 
 
300 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  41.24 
 
 
305 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  43.17 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2380  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.91 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  35.97 
 
 
298 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  35.36 
 
 
294 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  42.35 
 
 
313 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  38.33 
 
 
314 aa  172  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  36.4 
 
 
300 aa  172  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  35.69 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  34.22 
 
 
273 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  43.3 
 
 
297 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1376  hypothetical protein  34.74 
 
 
318 aa  150  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  35.79 
 
 
291 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5501  hypothetical protein  46.69 
 
 
297 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3249  hypothetical protein  34.74 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538989  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.09 
 
 
300 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0911  hypothetical protein  31.29 
 
 
303 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  38.68 
 
 
301 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  32.29 
 
 
303 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  29.59 
 
 
307 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
367 aa  87.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  30.14 
 
 
307 aa  85.5  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  26.46 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  29.45 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  26.12 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3681  hypothetical protein  27.24 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  29.07 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25.77 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  25.77 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.86 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  26.02 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  27.97 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  26.49 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>