More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0444 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 324 aa  617  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.96 
 
 		 306 aa  335  7e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  52.52 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  54.55 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2380  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.11 
 
 		 324 aa  256  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  39.47 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.75 
 
 		 293 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.79 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  41.24 
 
 		 343 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  40.69 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  39.45 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  39.45 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  39.79 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  40.55 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  40.61 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  40.55 
 
 		 293 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  40.55 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  39.1 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  40.69 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  39.38 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  41.25 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  38.41 
 
 		 298 aa  185  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.2 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  41.52 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  42.96 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  41.03 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  41.03 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  42.66 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.42 
 
 		 295 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  38.75 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  40.69 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  40.69 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.72 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  40.69 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  40.69 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  39.08 
 
 		 297 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  40.41 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  39.86 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  39.86 
 
 		 293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  37.41 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  37.41 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.41 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  37.41 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  37.41 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  37.41 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  37.41 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  37.76 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  39.93 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  39.07 
 
 		 365 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  39.74 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.42 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  40.41 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.41 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  37.71 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  37.37 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  37.5 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  37.37 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  37.5 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  32.7 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  37.85 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  35.45 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6025  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.14 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  34.92 
 
 		 298 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  34.05 
 
 		 307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  35.37 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  31.65 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  35.86 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  31.65 
 
 		 296 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  35.48 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  29.57 
 
 		 294 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  30.87 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  37.12 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  38.68 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1376  hypothetical protein  29.93 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  30 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  29.67 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  38.68 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  36.49 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  33.56 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  32.57 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  28.62 
 
 		 273 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3249  hypothetical protein  32.29 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538989  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.79 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  30.77 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5501  hypothetical protein  37.98 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  31.89 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  28.47 
 
 		 288 aa  89.7  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0911  hypothetical protein  27.89 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  28.34 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3681  hypothetical protein  29.63 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  25.9 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  28.78 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  28.52 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  27.59 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  28.18 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  28.07 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  28.18 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>