More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5590 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.72 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.86 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  32.17 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.89 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.84 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  31.8 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  32.46 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  33.86 
 
 		 306 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  33.54 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  33.33 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  33.87 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  33.87 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  32.43 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  33.23 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  33.54 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.33 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  31.91 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  32.13 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  32.55 
 
 		 306 aa  116  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  32.55 
 
 		 306 aa  116  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.34 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.42 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.88 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  31.54 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  31.54 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  31.54 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  31.54 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  31.21 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  33.44 
 
 		 310 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  30.41 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  32.26 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  32.08 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.52 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  32.48 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.89 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  32.89 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  32.89 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  32.89 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  32.89 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  33.09 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.36 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  33.66 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  31.02 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4675  hypothetical protein  31.65 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  27.24 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  30.38 
 
 		 494 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  31.16 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4337  hypothetical protein  31.45 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  28.47 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  26.38 
 
 		 305 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.33 
 
 		 295 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1407  integral membrane protein  30.36 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3083  hypothetical protein  30.36 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1535  integral membrane protein  30.36 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1402  integral membrane protein  30.36 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.33 
 
 		 295 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0663  hypothetical protein  30.36 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.467844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0489  hypothetical protein  30.36 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1203  hypothetical protein  30.36 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0889205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  27.92 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1110  hypothetical protein  30.66 
 
 		 392 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2188  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.2 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.723736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1111  hypothetical protein  30.66 
 
 		 392 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  26.23 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  27.76 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  31.43 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0956  peptide methionine sulfoxide reductase  30.43 
 
 		 519 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2549  hypothetical protein  30.23 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  24.68 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  25 
 
 		 305 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  25 
 
 		 305 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  25 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  25.82 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  25.32 
 
 		 305 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0747  hypothetical protein  28.57 
 
 		 400 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.530667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1228  hypothetical protein  28.57 
 
 		 400 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1201  hypothetical protein  28.57 
 
 		 402 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204073  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.3 
 
 		 348 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1941  hypothetical protein  29.97 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469065 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 		 367 aa  82.4  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2135  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.63 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1580  hypothetical protein  33.11 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  26.17 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2864  hypothetical protein  29.87 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.9 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4022  hypothetical protein  29.75 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486719 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.1 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  27.89 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1533  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.38 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  27.23 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  26.88 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  28.76 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  24.3 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  28.72 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  24.06 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  23.99 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  27.3 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  24.06 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>