More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0382 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  590  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.99 
 
 
321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  50.71 
 
 
326 aa  218  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.91 
 
 
315 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.89 
 
 
321 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.96 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  41.3 
 
 
296 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  39.41 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.7 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.21 
 
 
299 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  42.8 
 
 
307 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  40.71 
 
 
296 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  38.03 
 
 
311 aa  156  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  39.19 
 
 
325 aa  156  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  38.87 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  38.94 
 
 
304 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  38.46 
 
 
304 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  38.56 
 
 
306 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.45 
 
 
305 aa  152  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  38.93 
 
 
296 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  39.52 
 
 
296 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  38.93 
 
 
296 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  39.02 
 
 
306 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0956  peptide methionine sulfoxide reductase  38.49 
 
 
519 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  40.77 
 
 
306 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  40.77 
 
 
306 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  40.77 
 
 
306 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  40.77 
 
 
306 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  37.73 
 
 
292 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  37.81 
 
 
318 aa  143  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  40.42 
 
 
306 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  41.38 
 
 
306 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  41.38 
 
 
306 aa  142  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3083  hypothetical protein  36.01 
 
 
311 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1535  integral membrane protein  36.01 
 
 
311 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1407  integral membrane protein  36.01 
 
 
311 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0489  hypothetical protein  36.01 
 
 
311 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.55 
 
 
309 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1402  integral membrane protein  36.01 
 
 
311 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1203  hypothetical protein  36.01 
 
 
311 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0889205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0663  hypothetical protein  36.01 
 
 
311 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.467844  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4675  hypothetical protein  38.78 
 
 
292 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.55 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  35.31 
 
 
311 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.55 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2188  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.29 
 
 
295 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.723736  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  36.4 
 
 
301 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2864  hypothetical protein  39.4 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  41.38 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  41.38 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  41.38 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  41.38 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  41.38 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  34.11 
 
 
309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.03 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  34.59 
 
 
306 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  36.73 
 
 
310 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.33 
 
 
306 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.17 
 
 
314 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2549  hypothetical protein  37.38 
 
 
304 aa  123  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  33.45 
 
 
494 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  36.4 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  37.96 
 
 
307 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1941  hypothetical protein  34.26 
 
 
299 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000469065 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  29.25 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  30.24 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4022  hypothetical protein  32.41 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486719 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1110  hypothetical protein  30.93 
 
 
392 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1111  hypothetical protein  31.54 
 
 
392 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948246  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4337  hypothetical protein  32.39 
 
 
414 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0747  hypothetical protein  31.9 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.530667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1228  hypothetical protein  31.9 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1201  hypothetical protein  31.54 
 
 
402 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204073  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  31.56 
 
 
305 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  28.39 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1580  hypothetical protein  39.79 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.4 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.26 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  28.39 
 
 
305 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2135  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.95 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  29.28 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  28.71 
 
 
305 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 
340 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  27.83 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  27.97 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  27.65 
 
 
305 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  27.65 
 
 
305 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  29.9 
 
 
321 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.61 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.02 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  29.37 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  27.95 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0216  hypothetical protein  33.56 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.030228  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  29.55 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  25.68 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.3 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  25.68 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>