More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0956 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0956  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
519 aa  1038    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  52.55 
 
 
222 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0835  peptide methionine sulfoxide reductase  51.53 
 
 
221 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  51.01 
 
 
220 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  48 
 
 
223 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4738  peptide methionine sulfoxide reductase  48.98 
 
 
216 aa  177  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2156  peptide methionine sulfoxide reductase  47.47 
 
 
218 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2080  methionine sulfoxide reductase A  46.97 
 
 
219 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39501  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3895  peptide methionine sulfoxide reductase  52.04 
 
 
233 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  49.49 
 
 
213 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  49.49 
 
 
213 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  36.14 
 
 
311 aa  170  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5321  methionine sulfoxide reductase A  48.5 
 
 
218 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  45.69 
 
 
229 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3157  peptide methionine sulfoxide reductase  47.47 
 
 
219 aa  167  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44940  Peptide methionine sulfoxide reductase  47.98 
 
 
216 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  44.39 
 
 
221 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  46.73 
 
 
222 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  46.43 
 
 
220 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0572  peptide methionine sulfoxide reductase  46.63 
 
 
219 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4995  methionine sulfoxide reductase A  43.94 
 
 
220 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3312  peptide methionine sulfoxide reductase  45.95 
 
 
219 aa  163  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1140  peptide methionine sulfoxide reductase  44.72 
 
 
221 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4941  methionine sulfoxide reductase A  48.74 
 
 
218 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0106  peptide methionine sulfoxide reductase  48.48 
 
 
217 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.145566  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4709  methionine sulfoxide reductase A  49.5 
 
 
218 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567677  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1862  protein-methionine-S-oxide reductase  41.41 
 
 
215 aa  161  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4419  methionine sulfoxide reductase A  47.45 
 
 
215 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  47.64 
 
 
225 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1335  peptide methionine sulfoxide reductase  47.83 
 
 
216 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.907867  normal  0.30291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0918  peptide methionine sulfoxide reductase  46.46 
 
 
220 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  47.83 
 
 
220 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  40.71 
 
 
296 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1091  peptide methionine sulfoxide reductase  46.07 
 
 
223 aa  159  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0222581  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2261  peptide methionine sulfoxide reductase  48.22 
 
 
211 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.366504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1892  peptide methionine sulfoxide reductase  48.48 
 
 
213 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  40 
 
 
296 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3480  peptide methionine sulfoxide reductase  44.72 
 
 
219 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  38.97 
 
 
296 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2260  methionine sulfoxide reductase A  44.44 
 
 
217 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0350484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  40.81 
 
 
296 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  38.97 
 
 
296 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0559  peptide methionine sulfoxide reductase  47.42 
 
 
224 aa  158  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48494  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1937  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 
246 aa  158  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2198  methionine sulfoxide reductase A  44.44 
 
 
217 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2211  peptide methionine sulfoxide reductase  47.42 
 
 
224 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63317  normal  0.954559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4867  methionine sulfoxide reductase A  46.52 
 
 
222 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974418  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0364  methionine sulfoxide reductase A  46.52 
 
 
222 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116305 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3294  peptide methionine sulfoxide reductase  45.13 
 
 
216 aa  156  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1074  peptide methionine sulfoxide reductase  43.08 
 
 
215 aa  156  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.813448  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4771  methionine sulfoxide reductase A  45.16 
 
 
215 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.33 
 
 
309 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5755  peptide methionine sulfoxide reductase  46.07 
 
 
215 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66330  peptide methionine sulfoxide reductase  46.07 
 
 
215 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1898  peptide methionine sulfoxide reductase  45.95 
 
 
212 aa  156  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  40.07 
 
 
312 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7872  methionine sulfoxide reductase A  46.73 
 
 
218 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1180  methionine sulfoxide reductase A  45.41 
 
 
222 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  42.93 
 
 
220 aa  154  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.12 
 
 
321 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  37.42 
 
 
304 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2177  peptide methionine sulfoxide reductase  42.71 
 
 
221 aa  154  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.532726 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5071  peptide methionine sulfoxide reductase  46.97 
 
 
220 aa  153  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04598  methionine sulfoxide reductase A  48.68 
 
 
216 aa  153  8.999999999999999e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0336  methionine sulfoxide reductase A  45.45 
 
 
222 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.337081 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1226  peptide methionine sulfoxide reductase  48.92 
 
 
224 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  37.46 
 
 
306 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3605  peptide methionine sulfoxide reductase  43.72 
 
 
219 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0459  methionine sulfoxide reductase A  46.03 
 
 
221 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156958  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08180  methionine-S-sulfoxide reductase  41.15 
 
 
222 aa  152  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0834233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0361  methionine sulfoxide reductase A  45.45 
 
 
240 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18473  normal  0.721253 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3281  peptide methionine sulfoxide reductase  43.72 
 
 
219 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  37.12 
 
 
306 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  38.82 
 
 
306 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  38.82 
 
 
306 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  38.82 
 
 
306 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  39.22 
 
 
306 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2294  peptide methionine sulfoxide reductase  41.62 
 
 
208 aa  149  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0908  methionine sulfoxide reductase A  45.7 
 
 
216 aa  149  9e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3417  methionine sulfoxide reductase A  44.22 
 
 
217 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2979  peptide methionine sulfoxide reductase  45.11 
 
 
222 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  41.42 
 
 
326 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0684  methionine sulfoxide reductase A  45.6 
 
 
228 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.909394  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3981  methionine sulfoxide reductase A  45.26 
 
 
219 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  38.54 
 
 
306 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  38.54 
 
 
306 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1312  methionine sulfoxide reductase A  44.33 
 
 
218 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000106862  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0405  peptide methionine sulfoxide reductase  45.16 
 
 
215 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0153  peptide methionine sulfoxide reductase  45.21 
 
 
217 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  38.89 
 
 
306 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  40.66 
 
 
307 aa  147  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2494  peptide methionine sulfoxide reductase  43.94 
 
 
218 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  38.64 
 
 
304 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.58 
 
 
299 aa  146  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.84 
 
 
306 aa  146  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1007  methionine sulfoxide reductase A  42.78 
 
 
218 aa  146  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1069  methionine sulfoxide reductase A  42.78 
 
 
218 aa  146  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  35.62 
 
 
316 aa  146  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.15 
 
 
315 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1311  methionine sulfoxide reductase A  46.71 
 
 
237 aa  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.518036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>