More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4941 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4941  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7872  methionine sulfoxide reductase A  82.11 
 
 		 218 aa  374  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5321  methionine sulfoxide reductase A  81.65 
 
 		 218 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4709  methionine sulfoxide reductase A  81.65 
 
 		 218 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4419  methionine sulfoxide reductase A  80 
 
 		 215 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2156  peptide methionine sulfoxide reductase  73.85 
 
 		 218 aa  332  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4512  peptide methionine sulfoxide reductase  70.18 
 
 		 218 aa  321  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4995  methionine sulfoxide reductase A  66.51 
 
 		 220 aa  316  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1140  peptide methionine sulfoxide reductase  69.72 
 
 		 221 aa  313  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2177  peptide methionine sulfoxide reductase  66.97 
 
 		 221 aa  310  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.532726 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2211  peptide methionine sulfoxide reductase  68.95 
 
 		 224 aa  308  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63317  normal  0.954559 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2198  methionine sulfoxide reductase A  67.59 
 
 		 217 aa  308  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0559  peptide methionine sulfoxide reductase  68.95 
 
 		 224 aa  308  5e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48494  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1226  peptide methionine sulfoxide reductase  68.95 
 
 		 224 aa  307  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2260  methionine sulfoxide reductase A  67.13 
 
 		 217 aa  305  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0350484 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  70.95 
 
 		 213 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  70 
 
 		 213 aa  304  7e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3294  peptide methionine sulfoxide reductase  66.67 
 
 		 216 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  67.45 
 
 		 220 aa  301  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0092  peptide methionine sulfoxide reductase  71.1 
 
 		 218 aa  301  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  65.9 
 
 		 220 aa  301  7.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  67.43 
 
 		 221 aa  300  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  64.68 
 
 		 223 aa  299  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2494  peptide methionine sulfoxide reductase  70.64 
 
 		 218 aa  298  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1312  methionine sulfoxide reductase A  66.83 
 
 		 218 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000106862  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  68.12 
 
 		 225 aa  296  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1180  methionine sulfoxide reductase A  64.49 
 
 		 222 aa  295  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3480  peptide methionine sulfoxide reductase  68.35 
 
 		 219 aa  293  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3312  peptide methionine sulfoxide reductase  62.39 
 
 		 219 aa  291  4e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1007  methionine sulfoxide reductase A  64.9 
 
 		 218 aa  291  5e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1892  peptide methionine sulfoxide reductase  70.39 
 
 		 213 aa  290  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1069  methionine sulfoxide reductase A  64.42 
 
 		 218 aa  289  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0835  peptide methionine sulfoxide reductase  68.98 
 
 		 221 aa  289  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1335  peptide methionine sulfoxide reductase  68.08 
 
 		 216 aa  288  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.907867  normal  0.30291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  69.05 
 
 		 222 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3605  peptide methionine sulfoxide reductase  67.43 
 
 		 219 aa  288  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2080  methionine sulfoxide reductase A  65.44 
 
 		 219 aa  287  7e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39501  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4738  peptide methionine sulfoxide reductase  65.73 
 
 		 216 aa  287  8e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1862  protein-methionine-S-oxide reductase  64.15 
 
 		 215 aa  285  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3281  peptide methionine sulfoxide reductase  66.51 
 
 		 219 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  65.07 
 
 		 220 aa  279  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2979  peptide methionine sulfoxide reductase  63.51 
 
 		 222 aa  278  4e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3981  methionine sulfoxide reductase A  63.18 
 
 		 219 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0106  peptide methionine sulfoxide reductase  64.95 
 
 		 217 aa  275  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.145566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1866  peptide methionine sulfoxide reductase  59.9 
 
 		 211 aa  275  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0773465  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04598  methionine sulfoxide reductase A  68.78 
 
 		 216 aa  275  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0684  methionine sulfoxide reductase A  68.25 
 
 		 228 aa  275  4e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.909394  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5755  peptide methionine sulfoxide reductase  63.64 
 
 		 215 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0572  peptide methionine sulfoxide reductase  70.9 
 
 		 219 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192366 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5071  peptide methionine sulfoxide reductase  64.98 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66330  peptide methionine sulfoxide reductase  64.11 
 
 		 215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2127  methionine sulfoxide reductase A  63.94 
 
 		 212 aa  271  5.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44940  Peptide methionine sulfoxide reductase  68.25 
 
 		 216 aa  271  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3417  methionine sulfoxide reductase A  62.39 
 
 		 217 aa  271  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2261  peptide methionine sulfoxide reductase  64.15 
 
 		 211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.366504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  61.11 
 
 		 220 aa  268  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1855  peptide methionine sulfoxide reductase  59.15 
 
 		 219 aa  268  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.600225  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  61.47 
 
 		 222 aa  266  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  61.06 
 
 		 229 aa  263  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001695  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  61.06 
 
 		 212 aa  263  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4771  methionine sulfoxide reductase A  60.29 
 
 		 215 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0405  peptide methionine sulfoxide reductase  61.24 
 
 		 215 aa  261  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3157  peptide methionine sulfoxide reductase  68.25 
 
 		 219 aa  258  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0918  peptide methionine sulfoxide reductase  59.26 
 
 		 220 aa  258  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0153  peptide methionine sulfoxide reductase  60.58 
 
 		 217 aa  254  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0459  methionine sulfoxide reductase A  60 
 
 		 221 aa  251  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3895  peptide methionine sulfoxide reductase  66 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  60 
 
 		 212 aa  249  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1898  peptide methionine sulfoxide reductase  59.71 
 
 		 212 aa  248  5e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00778  methionine sulfoxide reductase A  60.58 
 
 		 212 aa  248  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0364  methionine sulfoxide reductase A  59.24 
 
 		 222 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116305 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4867  methionine sulfoxide reductase A  58.29 
 
 		 222 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974418  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  59.05 
 
 		 213 aa  244  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0336  methionine sulfoxide reductase A  57.35 
 
 		 222 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.337081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0361  methionine sulfoxide reductase A  57.35 
 
 		 240 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18473  normal  0.721253 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  56.6 
 
 		 213 aa  242  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3626  methionine sulfoxide reductase A  57.97 
 
 		 212 aa  242  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  60.59 
 
 		 212 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3961  methionine sulfoxide reductase A  57.97 
 
 		 212 aa  242  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3771  methionine sulfoxide reductase A  57.97 
 
 		 212 aa  242  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1937  peptide methionine sulfoxide reductase  59.9 
 
 		 246 aa  238  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  55.19 
 
 		 212 aa  238  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2294  peptide methionine sulfoxide reductase  56.85 
 
 		 208 aa  238  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  59.89 
 
 		 191 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3576  methionine sulfoxide reductase A  55.66 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0908  methionine sulfoxide reductase A  60.8 
 
 		 216 aa  234  6e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0432  peptide methionine sulfoxide reductase MSRA  61.11 
 
 		 216 aa  234  7e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.025885  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1031  methionine sulfoxide reductase A  60.8 
 
 		 216 aa  234  8e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.221296  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5736  methionine sulfoxide reductase A  61.08 
 
 		 212 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04090  methionine sulfoxide reductase A  61.08 
 
 		 212 aa  225  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3773  peptide methionine sulfoxide reductase  61.08 
 
 		 212 aa  225  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.978069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4789  methionine sulfoxide reductase A  61.08 
 
 		 212 aa  225  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04053  hypothetical protein  61.08 
 
 		 212 aa  225  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3788  methionine sulfoxide reductase A  61.08 
 
 		 212 aa  225  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4473  methionine sulfoxide reductase A  61.08 
 
 		 212 aa  225  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4772  methionine sulfoxide reductase A  59.71 
 
 		 212 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4827  methionine sulfoxide reductase A  59.71 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4806  methionine sulfoxide reductase A  59.71 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4863  methionine sulfoxide reductase A  60.59 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4687  methionine sulfoxide reductase A  59.71 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>