More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0336 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0336  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 222 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.337081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0361  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 240 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18473  normal  0.721253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4867  methionine sulfoxide reductase A  96.4 
 
 		 222 aa  453  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974418  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0364  methionine sulfoxide reductase A  97.3 
 
 		 222 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0459  methionine sulfoxide reductase A  84.68 
 
 		 221 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4771  methionine sulfoxide reductase A  79.63 
 
 		 215 aa  367  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0405  peptide methionine sulfoxide reductase  80.56 
 
 		 215 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  68.69 
 
 		 225 aa  296  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5755  peptide methionine sulfoxide reductase  65.28 
 
 		 215 aa  288  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0572  peptide methionine sulfoxide reductase  69.12 
 
 		 219 aa  286  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66330  peptide methionine sulfoxide reductase  64.35 
 
 		 215 aa  284  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1180  methionine sulfoxide reductase A  65.7 
 
 		 222 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44940  Peptide methionine sulfoxide reductase  66.97 
 
 		 216 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4995  methionine sulfoxide reductase A  62.44 
 
 		 220 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  64.59 
 
 		 220 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2198  methionine sulfoxide reductase A  62.09 
 
 		 217 aa  271  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4738  peptide methionine sulfoxide reductase  64.79 
 
 		 216 aa  271  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2156  peptide methionine sulfoxide reductase  64.59 
 
 		 218 aa  271  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3312  peptide methionine sulfoxide reductase  61.4 
 
 		 219 aa  271  8.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  66.02 
 
 		 229 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0835  peptide methionine sulfoxide reductase  65.73 
 
 		 221 aa  269  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  63.77 
 
 		 221 aa  269  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2260  methionine sulfoxide reductase A  61.61 
 
 		 217 aa  268  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0350484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  60.65 
 
 		 223 aa  267  7e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001695  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  61.5 
 
 		 212 aa  267  8e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  64.42 
 
 		 222 aa  265  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1862  protein-methionine-S-oxide reductase  61.17 
 
 		 215 aa  263  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  60 
 
 		 213 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3294  peptide methionine sulfoxide reductase  60.98 
 
 		 216 aa  260  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2127  methionine sulfoxide reductase A  60 
 
 		 212 aa  258  6e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  61.9 
 
 		 220 aa  257  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3981  methionine sulfoxide reductase A  59.9 
 
 		 219 aa  255  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2979  peptide methionine sulfoxide reductase  59.22 
 
 		 222 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0684  methionine sulfoxide reductase A  61.9 
 
 		 228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.909394  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2177  peptide methionine sulfoxide reductase  61.27 
 
 		 221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.532726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1140  peptide methionine sulfoxide reductase  61.27 
 
 		 221 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1892  peptide methionine sulfoxide reductase  60.95 
 
 		 213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7872  methionine sulfoxide reductase A  63.41 
 
 		 218 aa  252  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00778  methionine sulfoxide reductase A  59.35 
 
 		 212 aa  250  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  59.9 
 
 		 220 aa  248  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0559  peptide methionine sulfoxide reductase  62.98 
 
 		 224 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48494  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2211  peptide methionine sulfoxide reductase  62.5 
 
 		 224 aa  247  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63317  normal  0.954559 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5071  peptide methionine sulfoxide reductase  60.38 
 
 		 220 aa  247  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  59.72 
 
 		 222 aa  246  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1312  methionine sulfoxide reductase A  58.57 
 
 		 218 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000106862  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  62.19 
 
 		 220 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1007  methionine sulfoxide reductase A  58.1 
 
 		 218 aa  245  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4941  methionine sulfoxide reductase A  57.35 
 
 		 218 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2261  peptide methionine sulfoxide reductase  60.1 
 
 		 211 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.366504 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1069  methionine sulfoxide reductase A  57.62 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04598  methionine sulfoxide reductase A  59.05 
 
 		 216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2080  methionine sulfoxide reductase A  60.29 
 
 		 219 aa  242  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1855  peptide methionine sulfoxide reductase  54.84 
 
 		 219 aa  241  5e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.600225  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0918  peptide methionine sulfoxide reductase  58.85 
 
 		 220 aa  241  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3895  peptide methionine sulfoxide reductase  65.13 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1226  peptide methionine sulfoxide reductase  61.06 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  54.76 
 
 		 212 aa  239  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1937  peptide methionine sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 246 aa  239  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3626  methionine sulfoxide reductase A  57.08 
 
 		 212 aa  237  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3961  methionine sulfoxide reductase A  57.08 
 
 		 212 aa  237  9e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3771  methionine sulfoxide reductase A  57.08 
 
 		 212 aa  237  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  57.14 
 
 		 213 aa  236  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4512  peptide methionine sulfoxide reductase  56.4 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0092  peptide methionine sulfoxide reductase  61.54 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0106  peptide methionine sulfoxide reductase  62.07 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.145566  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4419  methionine sulfoxide reductase A  61.22 
 
 		 215 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  57.29 
 
 		 213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5321  methionine sulfoxide reductase A  59.9 
 
 		 218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1335  peptide methionine sulfoxide reductase  58.62 
 
 		 216 aa  232  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.907867  normal  0.30291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3417  methionine sulfoxide reductase A  55.19 
 
 		 217 aa  232  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2494  peptide methionine sulfoxide reductase  59.61 
 
 		 218 aa  232  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08180  methionine-S-sulfoxide reductase  56.13 
 
 		 222 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0834233 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0908  methionine sulfoxide reductase A  55.2 
 
 		 216 aa  231  5e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1031  methionine sulfoxide reductase A  55.66 
 
 		 216 aa  231  8.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.221296  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3576  methionine sulfoxide reductase A  54.29 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1898  peptide methionine sulfoxide reductase  56.59 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1896  peptide methionine sulfoxide reductase  55.4 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.486039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2294  peptide methionine sulfoxide reductase  57.44 
 
 		 208 aa  229  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0153  peptide methionine sulfoxide reductase  55.76 
 
 		 217 aa  228  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  54.98 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0974  peptide methionine sulfoxide reductase  53.55 
 
 		 214 aa  227  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  53.33 
 
 		 212 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3157  peptide methionine sulfoxide reductase  59.79 
 
 		 219 aa  223  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1866  peptide methionine sulfoxide reductase  55.67 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0773465  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0936  peptide methionine sulfoxide reductase  54.29 
 
 		 225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4709  methionine sulfoxide reductase A  60.73 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4772  methionine sulfoxide reductase A  56.4 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4676  methionine sulfoxide reductase A  55.92 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4687  methionine sulfoxide reductase A  56.4 
 
 		 212 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3605  peptide methionine sulfoxide reductase  57.37 
 
 		 219 aa  215  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4806  methionine sulfoxide reductase A  55.92 
 
 		 212 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3480  peptide methionine sulfoxide reductase  57.37 
 
 		 219 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4827  methionine sulfoxide reductase A  55.92 
 
 		 212 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3281  peptide methionine sulfoxide reductase  57.37 
 
 		 219 aa  214  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  58.43 
 
 		 191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5736  methionine sulfoxide reductase A  55.45 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3773  peptide methionine sulfoxide reductase  55.45 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.978069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3788  methionine sulfoxide reductase A  55.45 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04053  hypothetical protein  55.45 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>