More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0835 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0835  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
221 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  71.36 
 
 
222 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3895  peptide methionine sulfoxide reductase  80.9 
 
 
233 aa  316  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  69.44 
 
 
221 aa  309  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4738  peptide methionine sulfoxide reductase  68.04 
 
 
216 aa  302  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5071  peptide methionine sulfoxide reductase  68.92 
 
 
220 aa  299  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  65.45 
 
 
220 aa  298  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  67.91 
 
 
220 aa  293  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7872  methionine sulfoxide reductase A  68.2 
 
 
218 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4941  methionine sulfoxide reductase A  68.98 
 
 
218 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  64.68 
 
 
223 aa  290  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  64.98 
 
 
220 aa  290  9e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1180  methionine sulfoxide reductase A  65.42 
 
 
222 aa  287  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  63.6 
 
 
229 aa  287  9e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0106  peptide methionine sulfoxide reductase  68.2 
 
 
217 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.145566  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  64.95 
 
 
225 aa  286  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2177  peptide methionine sulfoxide reductase  64.81 
 
 
221 aa  286  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.532726 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3294  peptide methionine sulfoxide reductase  66.2 
 
 
216 aa  286  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2156  peptide methionine sulfoxide reductase  65.58 
 
 
218 aa  285  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  64.38 
 
 
222 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2198  methionine sulfoxide reductase A  65.28 
 
 
217 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5321  methionine sulfoxide reductase A  71.43 
 
 
218 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1140  peptide methionine sulfoxide reductase  64.35 
 
 
221 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  67.63 
 
 
213 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2260  methionine sulfoxide reductase A  64.81 
 
 
217 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0350484 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1892  peptide methionine sulfoxide reductase  68.12 
 
 
213 aa  282  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4995  methionine sulfoxide reductase A  61.11 
 
 
220 aa  281  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  66.18 
 
 
213 aa  281  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3312  peptide methionine sulfoxide reductase  63.51 
 
 
219 aa  280  9e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3417  methionine sulfoxide reductase A  65.71 
 
 
217 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0684  methionine sulfoxide reductase A  67.3 
 
 
228 aa  279  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.909394  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1312  methionine sulfoxide reductase A  64.02 
 
 
218 aa  278  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000106862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4867  methionine sulfoxide reductase A  67.14 
 
 
222 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974418  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1898  peptide methionine sulfoxide reductase  65.38 
 
 
212 aa  276  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4771  methionine sulfoxide reductase A  65.38 
 
 
215 aa  275  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1007  methionine sulfoxide reductase A  63.38 
 
 
218 aa  275  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0918  peptide methionine sulfoxide reductase  62.1 
 
 
220 aa  275  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2494  peptide methionine sulfoxide reductase  64.84 
 
 
218 aa  275  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0364  methionine sulfoxide reductase A  66.67 
 
 
222 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4512  peptide methionine sulfoxide reductase  62.73 
 
 
218 aa  274  9e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0336  methionine sulfoxide reductase A  65.73 
 
 
222 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.337081 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1069  methionine sulfoxide reductase A  62.91 
 
 
218 aa  273  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66330  peptide methionine sulfoxide reductase  67.15 
 
 
215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0361  methionine sulfoxide reductase A  65.73 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18473  normal  0.721253 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4419  methionine sulfoxide reductase A  68.69 
 
 
215 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5755  peptide methionine sulfoxide reductase  66.18 
 
 
215 aa  270  9e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0559  peptide methionine sulfoxide reductase  66.05 
 
 
224 aa  270  9e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0459  methionine sulfoxide reductase A  63.38 
 
 
221 aa  270  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156958  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1862  protein-methionine-S-oxide reductase  60.75 
 
 
215 aa  270  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04598  methionine sulfoxide reductase A  66.36 
 
 
216 aa  270  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2211  peptide methionine sulfoxide reductase  65.58 
 
 
224 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63317  normal  0.954559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4709  methionine sulfoxide reductase A  70.05 
 
 
218 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567677  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  60 
 
 
220 aa  267  7e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3981  methionine sulfoxide reductase A  60.81 
 
 
219 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0405  peptide methionine sulfoxide reductase  66.35 
 
 
215 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1335  peptide methionine sulfoxide reductase  64.56 
 
 
216 aa  263  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.907867  normal  0.30291 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2080  methionine sulfoxide reductase A  63.89 
 
 
219 aa  263  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39501  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2127  methionine sulfoxide reductase A  63.77 
 
 
212 aa  262  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1226  peptide methionine sulfoxide reductase  64.65 
 
 
224 aa  262  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2979  peptide methionine sulfoxide reductase  61.97 
 
 
222 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08180  methionine-S-sulfoxide reductase  59.07 
 
 
222 aa  260  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0834233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3480  peptide methionine sulfoxide reductase  64.09 
 
 
219 aa  259  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2261  peptide methionine sulfoxide reductase  61.68 
 
 
211 aa  258  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.366504 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1866  peptide methionine sulfoxide reductase  62.44 
 
 
211 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0773465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0572  peptide methionine sulfoxide reductase  67.01 
 
 
219 aa  257  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0092  peptide methionine sulfoxide reductase  64.09 
 
 
218 aa  257  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44940  Peptide methionine sulfoxide reductase  65.46 
 
 
216 aa  255  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3605  peptide methionine sulfoxide reductase  62.27 
 
 
219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3281  peptide methionine sulfoxide reductase  62.27 
 
 
219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1855  peptide methionine sulfoxide reductase  57.35 
 
 
219 aa  252  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.600225  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1091  peptide methionine sulfoxide reductase  57.4 
 
 
223 aa  252  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0222581  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  60.1 
 
 
212 aa  251  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001695  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  58.22 
 
 
212 aa  249  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1937  peptide methionine sulfoxide reductase  58.96 
 
 
246 aa  249  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2640  peptide methionine sulfoxide reductase  60 
 
 
225 aa  248  5e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0936  peptide methionine sulfoxide reductase  59.24 
 
 
225 aa  248  6e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2294  peptide methionine sulfoxide reductase  60.3 
 
 
208 aa  245  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  57.94 
 
 
213 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0908  methionine sulfoxide reductase A  60.58 
 
 
216 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0153  peptide methionine sulfoxide reductase  56.94 
 
 
217 aa  243  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  61.5 
 
 
191 aa  242  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3626  methionine sulfoxide reductase A  60.58 
 
 
212 aa  241  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3961  methionine sulfoxide reductase A  60.58 
 
 
212 aa  241  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3771  methionine sulfoxide reductase A  60.58 
 
 
212 aa  241  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3157  peptide methionine sulfoxide reductase  62.91 
 
 
219 aa  241  7e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1031  methionine sulfoxide reductase A  60.1 
 
 
216 aa  241  9e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.221296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  59.13 
 
 
212 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  60 
 
 
213 aa  238  8e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3576  methionine sulfoxide reductase A  57.69 
 
 
212 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  57.21 
 
 
212 aa  237  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0974  peptide methionine sulfoxide reductase  56.07 
 
 
214 aa  234  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1896  peptide methionine sulfoxide reductase  53.18 
 
 
223 aa  232  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.486039  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00778  methionine sulfoxide reductase A  57.35 
 
 
212 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1074  peptide methionine sulfoxide reductase  56.07 
 
 
215 aa  229  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.813448  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4772  methionine sulfoxide reductase A  61.34 
 
 
212 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4676  methionine sulfoxide reductase A  59.79 
 
 
212 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4687  methionine sulfoxide reductase A  60.31 
 
 
212 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4806  methionine sulfoxide reductase A  60.31 
 
 
212 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4827  methionine sulfoxide reductase A  60.31 
 
 
212 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0432  peptide methionine sulfoxide reductase MSRA  56.38 
 
 
216 aa  222  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.025885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>