More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4771 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4771  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 215 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0405  peptide methionine sulfoxide reductase  91.63 
 
 		 215 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4867  methionine sulfoxide reductase A  80.09 
 
 		 222 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974418  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0336  methionine sulfoxide reductase A  79.63 
 
 		 222 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.337081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0361  methionine sulfoxide reductase A  79.63 
 
 		 240 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18473  normal  0.721253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0459  methionine sulfoxide reductase A  81.86 
 
 		 221 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0364  methionine sulfoxide reductase A  80.09 
 
 		 222 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5755  peptide methionine sulfoxide reductase  71.63 
 
 		 215 aa  315  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66330  peptide methionine sulfoxide reductase  70.7 
 
 		 215 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0572  peptide methionine sulfoxide reductase  70.56 
 
 		 219 aa  299  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192366 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  65.26 
 
 		 225 aa  292  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2198  methionine sulfoxide reductase A  66.83 
 
 		 217 aa  288  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2260  methionine sulfoxide reductase A  66.34 
 
 		 217 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0350484 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4995  methionine sulfoxide reductase A  65.37 
 
 		 220 aa  284  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44940  Peptide methionine sulfoxide reductase  66.36 
 
 		 216 aa  281  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1180  methionine sulfoxide reductase A  64.88 
 
 		 222 aa  278  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  62.02 
 
 		 213 aa  278  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2156  peptide methionine sulfoxide reductase  63.77 
 
 		 218 aa  278  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  65.37 
 
 		 220 aa  278  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  61.54 
 
 		 213 aa  275  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  59.81 
 
 		 223 aa  274  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3981  methionine sulfoxide reductase A  62.44 
 
 		 219 aa  272  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2979  peptide methionine sulfoxide reductase  62.56 
 
 		 222 aa  272  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  64.08 
 
 		 222 aa  271  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3312  peptide methionine sulfoxide reductase  62.32 
 
 		 219 aa  271  7e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0835  peptide methionine sulfoxide reductase  65.38 
 
 		 221 aa  270  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4738  peptide methionine sulfoxide reductase  62.68 
 
 		 216 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1892  peptide methionine sulfoxide reductase  62.2 
 
 		 213 aa  268  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7872  methionine sulfoxide reductase A  64.53 
 
 		 218 aa  268  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1862  protein-methionine-S-oxide reductase  61.27 
 
 		 215 aa  267  8.999999999999999e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3294  peptide methionine sulfoxide reductase  62.07 
 
 		 216 aa  266  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2127  methionine sulfoxide reductase A  59.42 
 
 		 212 aa  263  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001695  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  58.94 
 
 		 212 aa  263  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1312  methionine sulfoxide reductase A  60.98 
 
 		 218 aa  262  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000106862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1140  peptide methionine sulfoxide reductase  61.39 
 
 		 221 aa  262  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4941  methionine sulfoxide reductase A  60.29 
 
 		 218 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  60.78 
 
 		 229 aa  261  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2177  peptide methionine sulfoxide reductase  60.4 
 
 		 221 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.532726 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  61.95 
 
 		 220 aa  261  6.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2211  peptide methionine sulfoxide reductase  63.59 
 
 		 224 aa  259  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63317  normal  0.954559 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0559  peptide methionine sulfoxide reductase  63.11 
 
 		 224 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48494  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1855  peptide methionine sulfoxide reductase  59.33 
 
 		 219 aa  259  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.600225  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  60.68 
 
 		 221 aa  258  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0684  methionine sulfoxide reductase A  63.11 
 
 		 228 aa  258  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.909394  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2261  peptide methionine sulfoxide reductase  59.9 
 
 		 211 aa  258  6e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.366504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  60.98 
 
 		 220 aa  257  9e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  62.14 
 
 		 220 aa  256  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1226  peptide methionine sulfoxide reductase  61.65 
 
 		 224 aa  254  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  61.19 
 
 		 222 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2080  methionine sulfoxide reductase A  62.57 
 
 		 219 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39501  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1335  peptide methionine sulfoxide reductase  59.62 
 
 		 216 aa  252  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.907867  normal  0.30291 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00778  methionine sulfoxide reductase A  60.39 
 
 		 212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04598  methionine sulfoxide reductase A  60.49 
 
 		 216 aa  252  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0092  peptide methionine sulfoxide reductase  61.65 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3417  methionine sulfoxide reductase A  58.77 
 
 		 217 aa  250  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1007  methionine sulfoxide reductase A  57.56 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0918  peptide methionine sulfoxide reductase  59.9 
 
 		 220 aa  249  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2494  peptide methionine sulfoxide reductase  61.19 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0106  peptide methionine sulfoxide reductase  63.96 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.145566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  57.28 
 
 		 212 aa  249  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  58.94 
 
 		 213 aa  249  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  59.62 
 
 		 212 aa  249  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1937  peptide methionine sulfoxide reductase  59.33 
 
 		 246 aa  248  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5321  methionine sulfoxide reductase A  61.03 
 
 		 218 aa  248  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1069  methionine sulfoxide reductase A  57.07 
 
 		 218 aa  248  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1031  methionine sulfoxide reductase A  60.85 
 
 		 216 aa  247  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.221296  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4512  peptide methionine sulfoxide reductase  56.46 
 
 		 218 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0908  methionine sulfoxide reductase A  62.81 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5071  peptide methionine sulfoxide reductase  58.1 
 
 		 220 aa  245  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3576  methionine sulfoxide reductase A  57.49 
 
 		 212 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  60.2 
 
 		 213 aa  244  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4419  methionine sulfoxide reductase A  59.79 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3626  methionine sulfoxide reductase A  57.49 
 
 		 212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1898  peptide methionine sulfoxide reductase  59.9 
 
 		 212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3961  methionine sulfoxide reductase A  57.49 
 
 		 212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3771  methionine sulfoxide reductase A  57.49 
 
 		 212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3895  peptide methionine sulfoxide reductase  65.98 
 
 		 233 aa  241  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0153  peptide methionine sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 217 aa  241  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  55.56 
 
 		 212 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1866  peptide methionine sulfoxide reductase  56.22 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0773465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5736  methionine sulfoxide reductase A  60.1 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04090  methionine sulfoxide reductase A  60.1 
 
 		 212 aa  232  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3773  peptide methionine sulfoxide reductase  60.1 
 
 		 212 aa  232  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.978069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4789  methionine sulfoxide reductase A  60.1 
 
 		 212 aa  232  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04053  hypothetical protein  60.1 
 
 		 212 aa  232  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4473  methionine sulfoxide reductase A  60.1 
 
 		 212 aa  232  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3788  methionine sulfoxide reductase A  60.1 
 
 		 212 aa  232  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0974  peptide methionine sulfoxide reductase  55.24 
 
 		 214 aa  231  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08180  methionine-S-sulfoxide reductase  54.29 
 
 		 222 aa  231  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0834233 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4772  methionine sulfoxide reductase A  60.1 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4863  methionine sulfoxide reductase A  59.62 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4687  methionine sulfoxide reductase A  60.1 
 
 		 212 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4676  methionine sulfoxide reductase A  59.62 
 
 		 212 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3157  peptide methionine sulfoxide reductase  59.89 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4806  methionine sulfoxide reductase A  59.62 
 
 		 212 aa  228  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4827  methionine sulfoxide reductase A  59.62 
 
 		 212 aa  228  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3605  peptide methionine sulfoxide reductase  59.04 
 
 		 219 aa  228  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4709  methionine sulfoxide reductase A  60.32 
 
 		 218 aa  227  9e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3281  peptide methionine sulfoxide reductase  59.04 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1896  peptide methionine sulfoxide reductase  53.33 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.486039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>