More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001695 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001695  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  100 
 
 
212 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00778  methionine sulfoxide reductase A  82.94 
 
 
212 aa  359  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2127  methionine sulfoxide reductase A  71.63 
 
 
212 aa  325  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7872  methionine sulfoxide reductase A  64.42 
 
 
218 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  61.35 
 
 
213 aa  271  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0459  methionine sulfoxide reductase A  61.14 
 
 
221 aa  270  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156958  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4867  methionine sulfoxide reductase A  61.5 
 
 
222 aa  268  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974418  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2261  peptide methionine sulfoxide reductase  63.11 
 
 
211 aa  268  5e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.366504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0361  methionine sulfoxide reductase A  61.5 
 
 
240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18473  normal  0.721253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0336  methionine sulfoxide reductase A  61.5 
 
 
222 aa  267  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.337081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  61.17 
 
 
222 aa  266  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  60.95 
 
 
220 aa  266  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  60.29 
 
 
225 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2211  peptide methionine sulfoxide reductase  61.43 
 
 
224 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63317  normal  0.954559 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  60.39 
 
 
213 aa  264  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4771  methionine sulfoxide reductase A  58.94 
 
 
215 aa  263  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0559  peptide methionine sulfoxide reductase  60.95 
 
 
224 aa  263  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  58.33 
 
 
223 aa  263  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4941  methionine sulfoxide reductase A  61.06 
 
 
218 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2198  methionine sulfoxide reductase A  60.58 
 
 
217 aa  262  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1180  methionine sulfoxide reductase A  62.25 
 
 
222 aa  263  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0364  methionine sulfoxide reductase A  60.56 
 
 
222 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  62.87 
 
 
229 aa  262  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4995  methionine sulfoxide reductase A  60.39 
 
 
220 aa  262  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1312  methionine sulfoxide reductase A  60.1 
 
 
218 aa  262  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000106862  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1855  peptide methionine sulfoxide reductase  58.1 
 
 
219 aa  261  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.600225  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  58.77 
 
 
212 aa  261  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1007  methionine sulfoxide reductase A  59.62 
 
 
218 aa  261  8e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1226  peptide methionine sulfoxide reductase  60.95 
 
 
224 aa  260  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2260  methionine sulfoxide reductase A  60.1 
 
 
217 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0350484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  58.65 
 
 
213 aa  259  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1892  peptide methionine sulfoxide reductase  59.9 
 
 
213 aa  258  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  62.62 
 
 
220 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1069  methionine sulfoxide reductase A  59.13 
 
 
218 aa  258  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  59.02 
 
 
220 aa  258  6e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1862  protein-methionine-S-oxide reductase  58.82 
 
 
215 aa  256  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4512  peptide methionine sulfoxide reductase  58.25 
 
 
218 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3312  peptide methionine sulfoxide reductase  60.29 
 
 
219 aa  255  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0405  peptide methionine sulfoxide reductase  58.45 
 
 
215 aa  254  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2156  peptide methionine sulfoxide reductase  57.49 
 
 
218 aa  254  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5755  peptide methionine sulfoxide reductase  59.42 
 
 
215 aa  254  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3576  methionine sulfoxide reductase A  57.42 
 
 
212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3981  methionine sulfoxide reductase A  58.54 
 
 
219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66330  peptide methionine sulfoxide reductase  59.42 
 
 
215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  56.46 
 
 
212 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0684  methionine sulfoxide reductase A  63.16 
 
 
228 aa  251  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.909394  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1866  peptide methionine sulfoxide reductase  59.49 
 
 
211 aa  251  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0773465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  58.85 
 
 
222 aa  251  6e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2080  methionine sulfoxide reductase A  61.58 
 
 
219 aa  249  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39501  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1140  peptide methionine sulfoxide reductase  56.8 
 
 
221 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4419  methionine sulfoxide reductase A  60.82 
 
 
215 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5321  methionine sulfoxide reductase A  60.31 
 
 
218 aa  247  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2177  peptide methionine sulfoxide reductase  56.8 
 
 
221 aa  247  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.532726 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3294  peptide methionine sulfoxide reductase  58.13 
 
 
216 aa  247  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  56.67 
 
 
213 aa  247  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0835  peptide methionine sulfoxide reductase  58.22 
 
 
221 aa  246  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  58.25 
 
 
221 aa  246  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4738  peptide methionine sulfoxide reductase  55.66 
 
 
216 aa  245  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0153  peptide methionine sulfoxide reductase  56.37 
 
 
217 aa  245  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  57.62 
 
 
212 aa  244  9e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2979  peptide methionine sulfoxide reductase  56.44 
 
 
222 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1335  peptide methionine sulfoxide reductase  58.71 
 
 
216 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.907867  normal  0.30291 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5071  peptide methionine sulfoxide reductase  58.57 
 
 
220 aa  243  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  58.25 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0572  peptide methionine sulfoxide reductase  60.58 
 
 
219 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192366 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3417  methionine sulfoxide reductase A  54.55 
 
 
217 aa  238  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0432  peptide methionine sulfoxide reductase MSRA  58.08 
 
 
216 aa  238  5.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.025885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4709  methionine sulfoxide reductase A  61.7 
 
 
218 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567677  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44940  Peptide methionine sulfoxide reductase  62.94 
 
 
216 aa  236  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3626  methionine sulfoxide reductase A  54.29 
 
 
212 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0092  peptide methionine sulfoxide reductase  58.54 
 
 
218 aa  236  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3771  methionine sulfoxide reductase A  54.29 
 
 
212 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3961  methionine sulfoxide reductase A  54.29 
 
 
212 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0106  peptide methionine sulfoxide reductase  56.73 
 
 
217 aa  235  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.145566  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0918  peptide methionine sulfoxide reductase  55.56 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2494  peptide methionine sulfoxide reductase  57.21 
 
 
218 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1031  methionine sulfoxide reductase A  55.34 
 
 
216 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.221296  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0908  methionine sulfoxide reductase A  55.34 
 
 
216 aa  231  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2294  peptide methionine sulfoxide reductase  58.55 
 
 
208 aa  231  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04598  methionine sulfoxide reductase A  54.29 
 
 
216 aa  229  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1898  peptide methionine sulfoxide reductase  52.45 
 
 
212 aa  228  7e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04090  methionine sulfoxide reductase A  58.1 
 
 
212 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3773  peptide methionine sulfoxide reductase  58.1 
 
 
212 aa  226  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.978069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5736  methionine sulfoxide reductase A  58.1 
 
 
212 aa  226  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3788  methionine sulfoxide reductase A  58.1 
 
 
212 aa  226  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04053  hypothetical protein  58.1 
 
 
212 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4473  methionine sulfoxide reductase A  58.1 
 
 
212 aa  226  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4789  methionine sulfoxide reductase A  58.1 
 
 
212 aa  226  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4772  methionine sulfoxide reductase A  56.6 
 
 
212 aa  224  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4676  methionine sulfoxide reductase A  56.13 
 
 
212 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1896  peptide methionine sulfoxide reductase  52.13 
 
 
223 aa  224  9e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.486039  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4863  methionine sulfoxide reductase A  57.62 
 
 
212 aa  223  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4806  methionine sulfoxide reductase A  56.13 
 
 
212 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4827  methionine sulfoxide reductase A  56.13 
 
 
212 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4687  methionine sulfoxide reductase A  56.13 
 
 
212 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3895  peptide methionine sulfoxide reductase  58.76 
 
 
233 aa  220  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1074  peptide methionine sulfoxide reductase  51.71 
 
 
215 aa  219  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.813448  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3480  peptide methionine sulfoxide reductase  55.21 
 
 
219 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0397  methionine sulfoxide reductase A  56.13 
 
 
213 aa  218  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434649  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3157  peptide methionine sulfoxide reductase  55.96 
 
 
219 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>