More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1896 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1896  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 223 aa  462  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.486039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08180  methionine-S-sulfoxide reductase  65.77 
 
 		 222 aa  310  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0834233 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0936  peptide methionine sulfoxide reductase  62.61 
 
 		 225 aa  289  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  57.41 
 
 		 229 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  54.05 
 
 		 223 aa  251  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  54.46 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  57.08 
 
 		 220 aa  248  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1074  peptide methionine sulfoxide reductase  56.52 
 
 		 215 aa  246  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.813448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3312  peptide methionine sulfoxide reductase  52.97 
 
 		 219 aa  246  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  53.6 
 
 		 220 aa  241  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4738  peptide methionine sulfoxide reductase  54.72 
 
 		 216 aa  237  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4995  methionine sulfoxide reductase A  52.29 
 
 		 220 aa  234  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1180  methionine sulfoxide reductase A  52.29 
 
 		 222 aa  234  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2156  peptide methionine sulfoxide reductase  52.73 
 
 		 218 aa  234  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0106  peptide methionine sulfoxide reductase  55.05 
 
 		 217 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.145566  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  53.49 
 
 		 225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1091  peptide methionine sulfoxide reductase  51.38 
 
 		 223 aa  233  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0222581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0918  peptide methionine sulfoxide reductase  53.39 
 
 		 220 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  53.42 
 
 		 221 aa  232  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0364  methionine sulfoxide reductase A  56.34 
 
 		 222 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0835  peptide methionine sulfoxide reductase  53.18 
 
 		 221 aa  230  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2198  methionine sulfoxide reductase A  50.92 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0336  methionine sulfoxide reductase A  55.4 
 
 		 222 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.337081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0361  methionine sulfoxide reductase A  55.66 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18473  normal  0.721253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4867  methionine sulfoxide reductase A  55.87 
 
 		 222 aa  228  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974418  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1007  methionine sulfoxide reductase A  52.83 
 
 		 218 aa  228  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  51.38 
 
 		 220 aa  228  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0974  peptide methionine sulfoxide reductase  53.55 
 
 		 214 aa  228  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2260  methionine sulfoxide reductase A  50.46 
 
 		 217 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0350484 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1898  peptide methionine sulfoxide reductase  52.2 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1069  methionine sulfoxide reductase A  52.36 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4771  methionine sulfoxide reductase A  53.33 
 
 		 215 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4512  peptide methionine sulfoxide reductase  53.52 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  53.74 
 
 		 213 aa  224  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1862  protein-methionine-S-oxide reductase  51.9 
 
 		 215 aa  224  9e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001695  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  52.13 
 
 		 212 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0405  peptide methionine sulfoxide reductase  54.03 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2640  peptide methionine sulfoxide reductase  51.8 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5071  peptide methionine sulfoxide reductase  53.46 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1312  methionine sulfoxide reductase A  50.47 
 
 		 218 aa  221  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000106862  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  52.8 
 
 		 213 aa  221  7e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  51.83 
 
 		 222 aa  221  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2177  peptide methionine sulfoxide reductase  52.58 
 
 		 221 aa  221  8e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.532726 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1937  peptide methionine sulfoxide reductase  53.39 
 
 		 246 aa  221  8e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1226  peptide methionine sulfoxide reductase  55.87 
 
 		 224 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1866  peptide methionine sulfoxide reductase  50.95 
 
 		 211 aa  221  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0773465  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1140  peptide methionine sulfoxide reductase  52.11 
 
 		 221 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2211  peptide methionine sulfoxide reductase  55.4 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63317  normal  0.954559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2261  peptide methionine sulfoxide reductase  52.88 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.366504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0459  methionine sulfoxide reductase A  51.18 
 
 		 221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  50.91 
 
 		 220 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3294  peptide methionine sulfoxide reductase  54.29 
 
 		 216 aa  218  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0559  peptide methionine sulfoxide reductase  54.46 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48494  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3480  peptide methionine sulfoxide reductase  53.52 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7872  methionine sulfoxide reductase A  56.37 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3417  methionine sulfoxide reductase A  54.9 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3981  methionine sulfoxide reductase A  50.94 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5755  peptide methionine sulfoxide reductase  53.33 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3281  peptide methionine sulfoxide reductase  53.05 
 
 		 219 aa  215  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2080  methionine sulfoxide reductase A  50.46 
 
 		 219 aa  214  7e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39501  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0684  methionine sulfoxide reductase A  50.7 
 
 		 228 aa  214  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.909394  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3605  peptide methionine sulfoxide reductase  53.05 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5321  methionine sulfoxide reductase A  53.88 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3895  peptide methionine sulfoxide reductase  54.11 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66330  peptide methionine sulfoxide reductase  52.38 
 
 		 215 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4941  methionine sulfoxide reductase A  52.31 
 
 		 218 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1855  peptide methionine sulfoxide reductase  48.36 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.600225  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1892  peptide methionine sulfoxide reductase  56.65 
 
 		 213 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3157  peptide methionine sulfoxide reductase  55.05 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2979  peptide methionine sulfoxide reductase  50.47 
 
 		 222 aa  208  7e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44940  Peptide methionine sulfoxide reductase  54.59 
 
 		 216 aa  207  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0153  peptide methionine sulfoxide reductase  48.58 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2494  peptide methionine sulfoxide reductase  51.63 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1335  peptide methionine sulfoxide reductase  50.92 
 
 		 216 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.907867  normal  0.30291 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  52.13 
 
 		 212 aa  205  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2127  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 		 212 aa  205  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0163  peptide methionine sulfoxide reductase  49.79 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4419  methionine sulfoxide reductase A  54.29 
 
 		 215 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0908  methionine sulfoxide reductase A  50.47 
 
 		 216 aa  203  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0572  peptide methionine sulfoxide reductase  53.65 
 
 		 219 aa  202  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192366 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04598  methionine sulfoxide reductase A  49.07 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  51.18 
 
 		 213 aa  201  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1031  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.221296  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4709  methionine sulfoxide reductase A  52.97 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  48.82 
 
 		 212 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3576  methionine sulfoxide reductase A  48.82 
 
 		 212 aa  199  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08400  methionine-S-sulfoxide reductase  48.42 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00778  methionine sulfoxide reductase A  50.48 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  51.66 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0092  peptide methionine sulfoxide reductase  52.38 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.489685 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04090  methionine sulfoxide reductase A  52 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3773  peptide methionine sulfoxide reductase  52 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.978069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4473  methionine sulfoxide reductase A  52 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04053  hypothetical protein  52 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4789  methionine sulfoxide reductase A  52 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3788  methionine sulfoxide reductase A  52 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4863  methionine sulfoxide reductase A  52 
 
 		 212 aa  195  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0254  peptide methionine sulfoxide reductase  50.26 
 
 		 249 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  47.17 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>