More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0163 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0163  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
238 aa  491  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4738  peptide methionine sulfoxide reductase  55.11 
 
 
216 aa  238  9e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  52.4 
 
 
220 aa  228  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1007  methionine sulfoxide reductase A  50.63 
 
 
218 aa  226  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  50.83 
 
 
225 aa  223  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1069  methionine sulfoxide reductase A  50.21 
 
 
218 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0918  peptide methionine sulfoxide reductase  51.09 
 
 
220 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0974  peptide methionine sulfoxide reductase  52 
 
 
214 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  51.34 
 
 
221 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4512  peptide methionine sulfoxide reductase  52.78 
 
 
218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1312  methionine sulfoxide reductase A  48.52 
 
 
218 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000106862  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  49.78 
 
 
220 aa  219  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2640  peptide methionine sulfoxide reductase  52.72 
 
 
225 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0106  peptide methionine sulfoxide reductase  53.57 
 
 
217 aa  218  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.145566  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4941  methionine sulfoxide reductase A  52.31 
 
 
218 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  51.48 
 
 
220 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4995  methionine sulfoxide reductase A  48.05 
 
 
220 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08400  methionine-S-sulfoxide reductase  51.79 
 
 
240 aa  215  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1855  peptide methionine sulfoxide reductase  47.83 
 
 
219 aa  215  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.600225  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04598  methionine sulfoxide reductase A  50.65 
 
 
216 aa  215  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  51.75 
 
 
222 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2080  methionine sulfoxide reductase A  52.63 
 
 
219 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39501  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2198  methionine sulfoxide reductase A  49.13 
 
 
217 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2211  peptide methionine sulfoxide reductase  52.21 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63317  normal  0.954559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5321  methionine sulfoxide reductase A  55.09 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44940  Peptide methionine sulfoxide reductase  54.03 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2260  methionine sulfoxide reductase A  49.13 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0350484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0684  methionine sulfoxide reductase A  50.22 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.909394  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3480  peptide methionine sulfoxide reductase  52.44 
 
 
219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3312  peptide methionine sulfoxide reductase  49.55 
 
 
219 aa  212  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0559  peptide methionine sulfoxide reductase  51.77 
 
 
224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48494  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1866  peptide methionine sulfoxide reductase  58.82 
 
 
211 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0773465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  46.58 
 
 
223 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1180  methionine sulfoxide reductase A  49.13 
 
 
222 aa  211  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2156  peptide methionine sulfoxide reductase  48.21 
 
 
218 aa  210  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  48.28 
 
 
220 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2127  methionine sulfoxide reductase A  47.09 
 
 
212 aa  210  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0835  peptide methionine sulfoxide reductase  57.43 
 
 
221 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001695  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  49.55 
 
 
212 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1862  protein-methionine-S-oxide reductase  46.75 
 
 
215 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7872  methionine sulfoxide reductase A  62.13 
 
 
218 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2294  peptide methionine sulfoxide reductase  51.2 
 
 
208 aa  209  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  47.77 
 
 
213 aa  208  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  47.32 
 
 
212 aa  207  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  47.77 
 
 
213 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2261  peptide methionine sulfoxide reductase  51.4 
 
 
211 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.366504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  52.36 
 
 
229 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0936  peptide methionine sulfoxide reductase  48.74 
 
 
225 aa  206  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  47.35 
 
 
212 aa  205  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1226  peptide methionine sulfoxide reductase  50.22 
 
 
224 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1896  peptide methionine sulfoxide reductase  49.79 
 
 
223 aa  205  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.486039  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3605  peptide methionine sulfoxide reductase  50.22 
 
 
219 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3281  peptide methionine sulfoxide reductase  50.22 
 
 
219 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4419  methionine sulfoxide reductase A  51.85 
 
 
215 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  50.67 
 
 
213 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4709  methionine sulfoxide reductase A  54.17 
 
 
218 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567677  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0153  peptide methionine sulfoxide reductase  49.11 
 
 
217 aa  202  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0572  peptide methionine sulfoxide reductase  50.93 
 
 
219 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192366 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  50.22 
 
 
213 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1898  peptide methionine sulfoxide reductase  48.85 
 
 
212 aa  201  7e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4676  methionine sulfoxide reductase A  50.48 
 
 
212 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00778  methionine sulfoxide reductase A  47.77 
 
 
212 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  48.66 
 
 
212 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3157  peptide methionine sulfoxide reductase  52.17 
 
 
219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2494  peptide methionine sulfoxide reductase  46.41 
 
 
218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1892  peptide methionine sulfoxide reductase  50.22 
 
 
213 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3576  methionine sulfoxide reductase A  46.43 
 
 
212 aa  199  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08180  methionine-S-sulfoxide reductase  49.12 
 
 
222 aa  198  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0834233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5755  peptide methionine sulfoxide reductase  48.43 
 
 
215 aa  198  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4772  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
212 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4771  methionine sulfoxide reductase A  48.21 
 
 
215 aa  198  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  52.6 
 
 
191 aa  197  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4827  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  48.7 
 
 
222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4806  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66330  peptide methionine sulfoxide reductase  47.98 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4687  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4867  methionine sulfoxide reductase A  48.67 
 
 
222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974418  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3895  peptide methionine sulfoxide reductase  53.77 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0397  methionine sulfoxide reductase A  49.05 
 
 
213 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434649  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0459  methionine sulfoxide reductase A  47.56 
 
 
221 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156958  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5071  peptide methionine sulfoxide reductase  49.57 
 
 
220 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2979  peptide methionine sulfoxide reductase  48.64 
 
 
222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4863  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
212 aa  195  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04090  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
212 aa  195  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3773  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
212 aa  195  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.978069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1335  peptide methionine sulfoxide reductase  49.54 
 
 
216 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.907867  normal  0.30291 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04053  hypothetical protein  50 
 
 
212 aa  195  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3788  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
212 aa  195  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4473  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
212 aa  195  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4789  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
212 aa  195  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1140  peptide methionine sulfoxide reductase  46.46 
 
 
221 aa  194  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0336  methionine sulfoxide reductase A  47.79 
 
 
222 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.337081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0364  methionine sulfoxide reductase A  48.44 
 
 
222 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0361  methionine sulfoxide reductase A  48 
 
 
240 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18473  normal  0.721253 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3626  methionine sulfoxide reductase A  46.36 
 
 
212 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3771  methionine sulfoxide reductase A  46.36 
 
 
212 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3961  methionine sulfoxide reductase A  46.36 
 
 
212 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3294  peptide methionine sulfoxide reductase  49.05 
 
 
216 aa  192  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2177  peptide methionine sulfoxide reductase  46.46 
 
 
221 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.532726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>