More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0861 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
220 aa  456  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0918  peptide methionine sulfoxide reductase  90.41 
 
 
220 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  67.43 
 
 
222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  65.28 
 
 
222 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  65.89 
 
 
220 aa  291  7e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  64.95 
 
 
220 aa  288  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4738  peptide methionine sulfoxide reductase  63.26 
 
 
216 aa  287  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  72.34 
 
 
191 aa  285  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0835  peptide methionine sulfoxide reductase  64.98 
 
 
221 aa  285  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5071  peptide methionine sulfoxide reductase  63.93 
 
 
220 aa  285  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2156  peptide methionine sulfoxide reductase  63.26 
 
 
218 aa  283  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  61.86 
 
 
221 aa  279  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  65.17 
 
 
229 aa  279  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  62.15 
 
 
225 aa  280  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  61.4 
 
 
223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1226  peptide methionine sulfoxide reductase  63.72 
 
 
224 aa  269  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4941  methionine sulfoxide reductase A  61.11 
 
 
218 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  60 
 
 
220 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4995  methionine sulfoxide reductase A  59.53 
 
 
220 aa  265  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1140  peptide methionine sulfoxide reductase  59.72 
 
 
221 aa  265  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2211  peptide methionine sulfoxide reductase  62.79 
 
 
224 aa  263  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63317  normal  0.954559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3895  peptide methionine sulfoxide reductase  68.34 
 
 
233 aa  263  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0106  peptide methionine sulfoxide reductase  62.21 
 
 
217 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.145566  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0559  peptide methionine sulfoxide reductase  62.33 
 
 
224 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48494  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3312  peptide methionine sulfoxide reductase  58.8 
 
 
219 aa  263  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2261  peptide methionine sulfoxide reductase  63.59 
 
 
211 aa  262  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.366504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2177  peptide methionine sulfoxide reductase  59.26 
 
 
221 aa  261  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.532726 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5321  methionine sulfoxide reductase A  63.01 
 
 
218 aa  260  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4512  peptide methionine sulfoxide reductase  60 
 
 
218 aa  260  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  62.09 
 
 
213 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1180  methionine sulfoxide reductase A  58.45 
 
 
222 aa  258  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1892  peptide methionine sulfoxide reductase  61.29 
 
 
213 aa  258  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2979  peptide methionine sulfoxide reductase  59.43 
 
 
222 aa  258  6e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7872  methionine sulfoxide reductase A  60.27 
 
 
218 aa  258  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2198  methionine sulfoxide reductase A  58.6 
 
 
217 aa  258  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4419  methionine sulfoxide reductase A  63.43 
 
 
215 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  61.14 
 
 
213 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1091  peptide methionine sulfoxide reductase  57.47 
 
 
223 aa  258  7e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0222581  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4771  methionine sulfoxide reductase A  62.14 
 
 
215 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2080  methionine sulfoxide reductase A  61.01 
 
 
219 aa  256  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39501  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3981  methionine sulfoxide reductase A  57.67 
 
 
219 aa  255  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2260  methionine sulfoxide reductase A  58.14 
 
 
217 aa  255  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0350484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3294  peptide methionine sulfoxide reductase  59.07 
 
 
216 aa  254  8e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1007  methionine sulfoxide reductase A  56.81 
 
 
218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3480  peptide methionine sulfoxide reductase  61.57 
 
 
219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5755  peptide methionine sulfoxide reductase  62.14 
 
 
215 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3281  peptide methionine sulfoxide reductase  61.75 
 
 
219 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3605  peptide methionine sulfoxide reductase  62.04 
 
 
219 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1312  methionine sulfoxide reductase A  56.81 
 
 
218 aa  251  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000106862  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0936  peptide methionine sulfoxide reductase  58.49 
 
 
225 aa  251  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1069  methionine sulfoxide reductase A  56.34 
 
 
218 aa  251  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3157  peptide methionine sulfoxide reductase  63.68 
 
 
219 aa  251  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66330  peptide methionine sulfoxide reductase  62.14 
 
 
215 aa  251  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1335  peptide methionine sulfoxide reductase  60.68 
 
 
216 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.907867  normal  0.30291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0364  methionine sulfoxide reductase A  63.18 
 
 
222 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116305 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1855  peptide methionine sulfoxide reductase  57.71 
 
 
219 aa  248  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.600225  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0684  methionine sulfoxide reductase A  60.85 
 
 
228 aa  248  6e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.909394  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4709  methionine sulfoxide reductase A  63.01 
 
 
218 aa  247  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567677  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2127  methionine sulfoxide reductase A  57.77 
 
 
212 aa  247  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4867  methionine sulfoxide reductase A  62.69 
 
 
222 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974418  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0336  methionine sulfoxide reductase A  62.19 
 
 
222 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.337081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0361  methionine sulfoxide reductase A  62.19 
 
 
240 aa  245  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18473  normal  0.721253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1898  peptide methionine sulfoxide reductase  58.82 
 
 
212 aa  245  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04598  methionine sulfoxide reductase A  58.29 
 
 
216 aa  244  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0459  methionine sulfoxide reductase A  58.29 
 
 
221 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156958  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001695  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  58.25 
 
 
212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08180  methionine-S-sulfoxide reductase  55.81 
 
 
222 aa  242  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0834233 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1862  protein-methionine-S-oxide reductase  53.77 
 
 
215 aa  242  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3417  methionine sulfoxide reductase A  56.42 
 
 
217 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0405  peptide methionine sulfoxide reductase  61.65 
 
 
215 aa  241  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1937  peptide methionine sulfoxide reductase  60.87 
 
 
246 aa  241  5e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44940  Peptide methionine sulfoxide reductase  64.02 
 
 
216 aa  241  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1896  peptide methionine sulfoxide reductase  53.6 
 
 
223 aa  241  6e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.486039  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2494  peptide methionine sulfoxide reductase  57.48 
 
 
218 aa  241  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1866  peptide methionine sulfoxide reductase  56.59 
 
 
211 aa  240  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0773465  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2294  peptide methionine sulfoxide reductase  59.6 
 
 
208 aa  240  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0572  peptide methionine sulfoxide reductase  60.4 
 
 
219 aa  238  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192366 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  60.41 
 
 
212 aa  237  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0153  peptide methionine sulfoxide reductase  55.77 
 
 
217 aa  236  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  55.4 
 
 
213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  55.56 
 
 
212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0974  peptide methionine sulfoxide reductase  55.09 
 
 
214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07230  methionine-S-sulfoxide reductase  59.26 
 
 
210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2640  peptide methionine sulfoxide reductase  55.56 
 
 
225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04090  methionine sulfoxide reductase A  60.1 
 
 
212 aa  231  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3773  peptide methionine sulfoxide reductase  60.1 
 
 
212 aa  231  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.978069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3788  methionine sulfoxide reductase A  60.1 
 
 
212 aa  231  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04053  hypothetical protein  60.1 
 
 
212 aa  231  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4789  methionine sulfoxide reductase A  60.1 
 
 
212 aa  231  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4473  methionine sulfoxide reductase A  60.1 
 
 
212 aa  231  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3771  methionine sulfoxide reductase A  56.52 
 
 
212 aa  230  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3626  methionine sulfoxide reductase A  56.52 
 
 
212 aa  230  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  56.52 
 
 
213 aa  230  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00778  methionine sulfoxide reductase A  57.28 
 
 
212 aa  230  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3961  methionine sulfoxide reductase A  56.52 
 
 
212 aa  230  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4863  methionine sulfoxide reductase A  59.59 
 
 
212 aa  229  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0092  peptide methionine sulfoxide reductase  60.29 
 
 
218 aa  229  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5736  methionine sulfoxide reductase A  59.59 
 
 
212 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0163  peptide methionine sulfoxide reductase  52.4 
 
 
238 aa  228  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4676  methionine sulfoxide reductase A  59.59 
 
 
212 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>