More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2864 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2864  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  60.33 
 
 
310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  52.43 
 
 
307 aa  230  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2135  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.94 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  48.34 
 
 
304 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  46.15 
 
 
304 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  45.97 
 
 
296 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  48.66 
 
 
306 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  48.66 
 
 
306 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  47.99 
 
 
306 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  45.64 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  43.82 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  43.82 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  43.82 
 
 
296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  42.76 
 
 
316 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  43.21 
 
 
292 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4675  hypothetical protein  45.05 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  43.17 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.86 
 
 
295 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.86 
 
 
295 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.46 
 
 
310 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  42.76 
 
 
301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  40.83 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  40.83 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  40.83 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  40.83 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  40.83 
 
 
306 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.81 
 
 
299 aa  169  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  38.91 
 
 
306 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  38.91 
 
 
306 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  35.79 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1580  hypothetical protein  46.62 
 
 
303 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  38.91 
 
 
306 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  38.91 
 
 
306 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  38.91 
 
 
306 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  38.91 
 
 
306 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  38.91 
 
 
306 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2549  hypothetical protein  39.79 
 
 
304 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.23 
 
 
306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  40.52 
 
 
326 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  37.76 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.46 
 
 
309 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  35.1 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.8 
 
 
309 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1402  integral membrane protein  38.91 
 
 
311 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3083  hypothetical protein  38.91 
 
 
311 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1535  integral membrane protein  38.91 
 
 
311 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0489  hypothetical protein  38.91 
 
 
311 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1203  hypothetical protein  38.91 
 
 
311 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0889205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0663  hypothetical protein  38.91 
 
 
311 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.467844  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1407  integral membrane protein  38.91 
 
 
311 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  39.74 
 
 
312 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  38.14 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.93 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  37.01 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  36.39 
 
 
494 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 
315 aa  109  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1201  hypothetical protein  36.7 
 
 
402 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204073  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0747  hypothetical protein  36.7 
 
 
400 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.530667  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1111  hypothetical protein  36.61 
 
 
392 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948246  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1228  hypothetical protein  36.7 
 
 
400 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.79 
 
 
321 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1110  hypothetical protein  36.05 
 
 
392 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4337  hypothetical protein  35.34 
 
 
414 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.32 
 
 
305 aa  99.8  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0956  peptide methionine sulfoxide reductase  33.23 
 
 
519 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  36.14 
 
 
296 aa  95.9  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 
309 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  24.36 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02859  integral membrane protein  38.89 
 
 
159 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1941  hypothetical protein  29.35 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000469065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  30.69 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  29.87 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  28.87 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  33.2 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.67 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  24.44 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  33.2 
 
 
395 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2188  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.23 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.723736  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  24.76 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  24.2 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  24.2 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  33.2 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  23.9 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  33.2 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.66 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  24.66 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  32.82 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  32.82 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  32.82 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  32.82 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  24.28 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02858  drug/metabolite transporter superfamily protein  45.1 
 
 
113 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  30.36 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  29.49 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>