More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2926 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 305 aa  605  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.87 
 
 		 309 aa  195  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  38.18 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  38.18 
 
 		 296 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  38.18 
 
 		 296 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  40.67 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  34.59 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  40.67 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  40.67 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  40.3 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  40.3 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  40.15 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  40.15 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.16 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  38.82 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  33.22 
 
 		 325 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 		 321 aa  122  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  32.99 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2188  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.41 
 
 		 295 aa  122  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.723736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  34.04 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  32.84 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  33.68 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  34.11 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  36.08 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  34.9 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  32.9 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  30.74 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  30.19 
 
 		 301 aa  116  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  34.56 
 
 		 306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  34.69 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  40.15 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  40.15 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  40.15 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  40.15 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  40.15 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  31.79 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2549  hypothetical protein  36.36 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.87 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  34.11 
 
 		 306 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.82 
 
 		 306 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1941  hypothetical protein  32.84 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.9 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 348 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  29.9 
 
 		 296 aa  95.5  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 		 309 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  28.33 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  29.33 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  27.4 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  28.19 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  29.61 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  28.62 
 
 		 305 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  28.62 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  28.14 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  28.62 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0956  peptide methionine sulfoxide reductase  32.41 
 
 		 519 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0489  hypothetical protein  28.48 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1203  hypothetical protein  28.48 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0889205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1407  integral membrane protein  28.48 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 		 296 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3083  hypothetical protein  28.48 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1535  integral membrane protein  28.48 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0663  hypothetical protein  28.48 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.467844  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1402  integral membrane protein  28.48 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  28.95 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  29.41 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  27.57 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.78 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  26.37 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2864  hypothetical protein  29.32 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  24.67 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.01 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  25.9 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  23.73 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  27.96 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.52 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  24.92 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0216  hypothetical protein  27.15 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.030228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  24.68 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  27.53 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  28.36 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  25.86 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  25.27 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4022  hypothetical protein  24.73 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  26.07 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  28.27 
 
 		 494 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  24.44 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.44 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  25.32 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  24.44 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  24.44 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>