More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4022 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4022  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.05 
 
 		 321 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  28.87 
 
 		 326 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  29.73 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  33.1 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  33.69 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  30.12 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3083  hypothetical protein  33.69 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1407  integral membrane protein  33.69 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1535  integral membrane protein  33.69 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0663  hypothetical protein  33.69 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.467844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0489  hypothetical protein  33.69 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1402  integral membrane protein  33.69 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1203  hypothetical protein  33.69 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0889205  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  30.71 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  30.71 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  30.07 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  30.71 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 		 305 aa  85.5  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  28.35 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  27.64 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  29.32 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  27.64 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  25.58 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  27.64 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  27.64 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  29.93 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  26.88 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  26.94 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  29.75 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  25.82 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  25.82 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  28.21 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  28.21 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.48 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  27.84 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  27.84 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  28.96 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  27.84 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  27.8 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  30.22 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  28.57 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  27.56 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  29.51 
 
 		 494 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  28.71 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  30.59 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  27.08 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.14 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4337  hypothetical protein  28.32 
 
 		 414 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.2 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  26.2 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1201  hypothetical protein  31.88 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204073  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  26.2 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.74 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  26.2 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  26.2 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  27.08 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  29.5 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4675  hypothetical protein  29.64 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1858  hypothetical protein  28.11 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  23.23 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0747  hypothetical protein  31.21 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.530667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1228  hypothetical protein  31.21 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0956  peptide methionine sulfoxide reductase  27.08 
 
 		 519 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  26.3 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  22.56 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.93 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.45 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  30.74 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  22.81 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  22.56 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  22.56 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  22.56 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  22.56 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  21.57 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  22.56 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.56 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1111  hypothetical protein  28.52 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948246  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 		 314 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  28.25 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1110  hypothetical protein  28.52 
 
 		 392 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  27.44 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  28.62 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  23.08 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.69 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.55 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  28.57 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  29.41 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  28.21 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>