More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0410 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 301 aa  584  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  98.01 
 
 		 301 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  89.7 
 
 		 301 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  72.24 
 
 		 301 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  70.31 
 
 		 301 aa  358  6e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  62.71 
 
 		 330 aa  331  9e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.69 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  59.87 
 
 		 426 aa  328  9e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  62.63 
 
 		 303 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  59.27 
 
 		 376 aa  318  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  59.27 
 
 		 312 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  58.94 
 
 		 312 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  61.59 
 
 		 311 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  61.59 
 
 		 311 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  62.5 
 
 		 311 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  61.59 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  55.14 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  54.79 
 
 		 303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  62.72 
 
 		 311 aa  301  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  55.78 
 
 		 308 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  55.78 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  55.44 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  56.01 
 
 		 310 aa  291  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  55.83 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  53.06 
 
 		 314 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  50.34 
 
 		 305 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  46.82 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  61.09 
 
 		 272 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  61.09 
 
 		 272 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  55.14 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  48.12 
 
 		 321 aa  248  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  48.97 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  48.01 
 
 		 315 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.46 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  47.51 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.8 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  52.08 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.9 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  45.17 
 
 		 315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  43.84 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  46.35 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  43.1 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  47.3 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  46.48 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  38.23 
 
 		 307 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  38.14 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  42.72 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  42.41 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  38.79 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  36.16 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  41.86 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.33 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0609  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.6 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  29.25 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  29.55 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2616  hypothetical protein  27.4 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.79 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  28.08 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  22.3 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  24.92 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  25.39 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  25.17 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  30 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  29.79 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0375  hypothetical protein  27.24 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00512602  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  28.07 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  30.46 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  27.27 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1850  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.84 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152184  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.18 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4847  transporter, EamA family  25.64 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0476  transporter, EamA family  26.02 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  24.54 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  26.55 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  27.44 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  27.15 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  27.71 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  26.26 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  24.75 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  27.71 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  29.35 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.27 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  28.33 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  27.21 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  30.25 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.69 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  27.08 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0525  EamA family protein  25.28 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  29.02 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  27.08 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0398  hypothetical protein  24.54 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  25 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>