More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3160 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  579  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.98 
 
 		 293 aa  275  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  52.43 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  50.5 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  49.83 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  48.16 
 
 		 376 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  48.16 
 
 		 312 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  47.16 
 
 		 426 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  47.83 
 
 		 312 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.32 
 
 		 311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  49.5 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.78 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.08 
 
 		 301 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  49.5 
 
 		 311 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  49.67 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  49.67 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  49.67 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  49.83 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  49.48 
 
 		 311 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  46.88 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.63 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  45.1 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  40.27 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  44.1 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  39.93 
 
 		 307 aa  206  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  46.72 
 
 		 272 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  46.72 
 
 		 272 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  46.91 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.96 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  43.88 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  42.62 
 
 		 303 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  42.62 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  40.73 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  45.18 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  41.75 
 
 		 321 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  42.11 
 
 		 310 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  44.59 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  40.47 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  40.13 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  44.44 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  39.8 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  36.75 
 
 		 315 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  40.27 
 
 		 304 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  41.05 
 
 		 308 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  39.71 
 
 		 312 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  40.27 
 
 		 314 aa  162  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  36.73 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  37.79 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  37.23 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  38.03 
 
 		 314 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  37.7 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  30.63 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  33.72 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1850  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.85 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152184  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.76 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  32.04 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  29.21 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  28.86 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  30.29 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  29.15 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2616  hypothetical protein  26.51 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  28.52 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  28.52 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  25.45 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  29.12 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  27.95 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  28.75 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.07 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  30.84 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  24.55 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3828  hypothetical protein  26.87 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  27.17 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0609  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.59 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  30.48 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0375  hypothetical protein  26.82 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00512602  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  24.91 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  27.31 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1548  integral membrane protein  28.5 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  29.57 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1657  hypothetical protein  28.5 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  27.88 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  29.57 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  27.72 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  28.18 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  29 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.29 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  29 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  29 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  29 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4755  exported membrane protein  29.91 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000669886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  29.37 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  29.41 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  29.86 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  28.72 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>