More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0572 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  622  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  68.87 
 
 		 301 aa  363  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.8 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.92 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  45.9 
 
 		 301 aa  208  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.26 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.91 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  42.86 
 
 		 301 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  42.56 
 
 		 426 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.75 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  44.59 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  42.58 
 
 		 376 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  46.74 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  41.29 
 
 		 330 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  42.39 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  42.07 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  40.82 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  43.1 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  40 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  43.05 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  42.71 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  44.41 
 
 		 301 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  44.98 
 
 		 311 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  44.98 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  44.98 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  41.55 
 
 		 321 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  44.26 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  38.26 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  37.58 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  44.29 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  40.57 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.21 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  40.07 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  42.35 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  40.21 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  39.86 
 
 		 308 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  42.52 
 
 		 313 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  39.72 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  35.93 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  41.22 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  35.95 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  38.16 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  36.79 
 
 		 286 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  42.68 
 
 		 272 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  42.68 
 
 		 272 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  36.39 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  36.61 
 
 		 297 aa  133  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  37.85 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  38.03 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  36.91 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  34.43 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  31.6 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  30.38 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  27.15 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  27.57 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  30.39 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  30 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  25.6 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.34 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  31.14 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  25.08 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  29.93 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  27.14 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  24.91 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  27.18 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  24.91 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.71 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  30.1 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  24.57 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  24.57 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  24.57 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  30.32 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  24.57 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  23.84 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  24.57 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  24.57 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  24.57 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  27.96 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  25.76 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  25.78 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.08 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.25 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  30.63 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.95 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  26.46 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  25.78 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  28.08 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>