283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2295 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  99.36 
 
 		 314 aa  597  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  48.11 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  45.24 
 
 		 321 aa  222  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  45.89 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  45.36 
 
 		 313 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.81 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.17 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  42.56 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  42.76 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  42.56 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  42.21 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  39.27 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  39.1 
 
 		 310 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  42.71 
 
 		 303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  39.34 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  42.37 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  43.4 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  39 
 
 		 330 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.67 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  41.18 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  37.46 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  40.86 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  39.02 
 
 		 426 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  41.31 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  41.64 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  41.64 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  41.64 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  37.7 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  37.7 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  37.38 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  40.88 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.27 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  41.95 
 
 		 312 aa  149  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  34.58 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.03 
 
 		 307 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  35.48 
 
 		 305 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  35.31 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  37.82 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  36.36 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  39.15 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  37.54 
 
 		 324 aa  125  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  31.77 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  34.44 
 
 		 317 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  29.22 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  30.74 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  36.6 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  36.6 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  31.6 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  29.39 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  33.22 
 
 		 311 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.87 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  30.8 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  29.1 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  27.91 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  27.76 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  29.69 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  31.3 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  28.21 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  27.76 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  28.15 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.28 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  30.71 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1236  hypothetical protein  27.68 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000572189  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  29.39 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.51 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  26.89 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5346  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  31.58 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  27.53 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  30.58 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 		 367 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  29.01 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.83 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  29.95 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.94 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1407  integral membrane protein  30.25 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3083  hypothetical protein  30.25 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1402  integral membrane protein  30.25 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1535  integral membrane protein  30.25 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0489  hypothetical protein  30.25 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  29.55 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  31.28 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1203  hypothetical protein  30.25 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0889205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0663  hypothetical protein  30.25 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.467844  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  27.68 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  30 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  25.24 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.66 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.44 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  25.63 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  31.56 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>