More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1801 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  568  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  54.73 
 
 
297 aa  293  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  38.83 
 
 
286 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  36.72 
 
 
307 aa  175  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  36.99 
 
 
307 aa  175  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  39.72 
 
 
426 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.93 
 
 
311 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  39.26 
 
 
330 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  40.44 
 
 
301 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  39.05 
 
 
305 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  39.36 
 
 
376 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  40.5 
 
 
303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  38.18 
 
 
304 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  39.36 
 
 
312 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  39.36 
 
 
312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.03 
 
 
301 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  39.14 
 
 
302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.3 
 
 
301 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  40.5 
 
 
311 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  36.73 
 
 
315 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  40.5 
 
 
311 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  36.36 
 
 
317 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  40.14 
 
 
311 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.97 
 
 
307 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.74 
 
 
293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  36.82 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  40.14 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  40.14 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  37.94 
 
 
324 aa  145  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  35.71 
 
 
304 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  37.92 
 
 
301 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  35.23 
 
 
303 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  35 
 
 
303 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  38.71 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  38.71 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  38.55 
 
 
301 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  32.66 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  33 
 
 
310 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  36.23 
 
 
299 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  33.22 
 
 
308 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  33.22 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  35.56 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  29.8 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  33 
 
 
308 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  31.16 
 
 
307 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  33 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  37.23 
 
 
314 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  31.27 
 
 
314 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  31.6 
 
 
314 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  26.06 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2616  hypothetical protein  29.63 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4847  transporter, EamA family  26.04 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1850  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.3 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152184  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  30.97 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  24.38 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0476  transporter, EamA family  25.69 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0525  EamA family protein  25.09 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  30.93 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0398  EamA family protein  24.38 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.52 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0386  DMT family permease  24.91 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00214072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0411  eama family protein  24.38 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  31.52 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0389  DMT family permease  24.38 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0456  transporter, EamA family  24.38 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.03 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0375  hypothetical protein  26.03 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00512602  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  31.21 
 
 
304 aa  67  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  31.55 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1657  hypothetical protein  30.32 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4663  exported membrane protein  28.51 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00303431  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0609  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4813  exported membrane protein  28.51 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000948191  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1548  integral membrane protein  30.32 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4673  exported membrane protein  28.51 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000162371  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0398  hypothetical protein  22.89 
 
 
316 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4791  hypothetical protein  28.51 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00231071  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4755  exported membrane protein  28.05 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000669886  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  28.71 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12940  membrane protein  26.09 
 
 
311 aa  63.5  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000993304  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3828  hypothetical protein  29.21 
 
 
311 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  28.81 
 
 
299 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  28.07 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  29.75 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 
329 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  26.8 
 
 
301 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.8 
 
 
301 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  26.8 
 
 
301 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  26.8 
 
 
301 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  26.8 
 
 
301 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  26.8 
 
 
301 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  26.8 
 
 
301 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  26.8 
 
 
301 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  27.84 
 
 
304 aa  59.7  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  32.26 
 
 
293 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  28.15 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  30.26 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>