More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0579 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  100 
 
 
426 aa  826    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  87.97 
 
 
376 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  94.87 
 
 
312 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  94.55 
 
 
312 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  76.25 
 
 
303 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  74.68 
 
 
311 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  74.68 
 
 
311 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  74.68 
 
 
311 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  94.76 
 
 
272 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  94.76 
 
 
272 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  74.03 
 
 
311 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  76.98 
 
 
311 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  67.63 
 
 
330 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.77 
 
 
311 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  59.93 
 
 
301 aa  332  8e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.53 
 
 
301 aa  329  7e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.87 
 
 
301 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  58 
 
 
301 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  58.45 
 
 
301 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  50.17 
 
 
303 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  50.17 
 
 
303 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  49.19 
 
 
308 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  49.51 
 
 
308 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  48.86 
 
 
308 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  47.7 
 
 
310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  47.16 
 
 
302 aa  232  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  46.64 
 
 
315 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  46.6 
 
 
305 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  44.16 
 
 
304 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  48.68 
 
 
308 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  47.62 
 
 
314 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  46.96 
 
 
304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  44.82 
 
 
321 aa  219  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.78 
 
 
293 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.05 
 
 
299 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  47.8 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.45 
 
 
307 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  43.61 
 
 
315 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  41.14 
 
 
307 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  42.81 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  41.61 
 
 
317 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  44.34 
 
 
324 aa  189  9e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  42.12 
 
 
301 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  36.79 
 
 
307 aa  186  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  42.17 
 
 
312 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  36.13 
 
 
307 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  36.3 
 
 
286 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  39.02 
 
 
314 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  38.69 
 
 
314 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  36.96 
 
 
297 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  38.75 
 
 
297 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  31.58 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.74 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.72 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 
312 aa  76.3  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0609  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.16 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.51 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  28.06 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  26.44 
 
 
311 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  28.06 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  28.42 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  28.42 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  28.42 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  26.76 
 
 
288 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  27.43 
 
 
294 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  29.56 
 
 
303 aa  64.7  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.04 
 
 
340 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  31.15 
 
 
310 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  27.97 
 
 
294 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  27.97 
 
 
294 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  27.97 
 
 
294 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  27.97 
 
 
294 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  31.15 
 
 
310 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.36 
 
 
315 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.12 
 
 
304 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  27.97 
 
 
294 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  27.97 
 
 
294 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  23.03 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 
293 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 
307 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  29.44 
 
 
299 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  27.6 
 
 
297 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  29.21 
 
 
296 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 
317 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  25.89 
 
 
299 aa  60.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.05 
 
 
293 aa  60.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  27.87 
 
 
297 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.57 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  29.51 
 
 
286 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  28.44 
 
 
314 aa  59.7  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  27.84 
 
 
286 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  26.86 
 
 
299 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 
299 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  25 
 
 
330 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  29.27 
 
 
300 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 
309 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  23.79 
 
 
293 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.64 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  23.47 
 
 
304 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.05 
 
 
295 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>