More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2135 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  607  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  70.13 
 
 		 303 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  70.47 
 
 		 303 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  64.69 
 
 		 308 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  63.43 
 
 		 308 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  64.36 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  63.99 
 
 		 310 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  63.7 
 
 		 308 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  53.62 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.4 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.06 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  51.55 
 
 		 301 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  50.48 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  54.03 
 
 		 313 aa  255  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  50.33 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  51.47 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.17 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  50 
 
 		 304 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  48.48 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  47.25 
 
 		 426 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  50 
 
 		 301 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  48.87 
 
 		 303 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  46.08 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  46.67 
 
 		 376 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  47.42 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  47.42 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  47.91 
 
 		 311 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  48.23 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  45.75 
 
 		 312 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  48.5 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  50.34 
 
 		 312 aa  207  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  45.26 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  45.74 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  45.14 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.07 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.42 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  41.84 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.61 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  47.37 
 
 		 272 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  47.37 
 
 		 272 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  41.48 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  41.8 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  39.53 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  41.49 
 
 		 317 aa  165  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  42.64 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  44.84 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  33.78 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  34.17 
 
 		 286 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  34.17 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  34.06 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  37.69 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  30.86 
 
 		 286 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  24.92 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  26.6 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  28.23 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.63 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.62 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  32.15 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  30.17 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.29 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.28 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  26.07 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  30.99 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  28.88 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.95 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.59 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.35 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  27.68 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  26.32 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  26.15 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  28.47 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  28.96 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  28.96 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  28.96 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.45 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  27.46 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.99 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  28.98 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  27.15 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  29.39 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  27.42 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  30.93 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  25.76 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  30.68 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  30.07 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  27.4 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  27.55 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  29.29 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  29.69 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  28.87 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  27.4 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  29.49 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  30.61 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>