254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0122 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.79 
 
 
299 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  48.8 
 
 
330 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.66 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.11 
 
 
311 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  45.7 
 
 
301 aa  227  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  46.49 
 
 
301 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.92 
 
 
301 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.58 
 
 
301 aa  225  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  46.98 
 
 
303 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  44.08 
 
 
426 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  49.66 
 
 
301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  43.09 
 
 
376 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  43.09 
 
 
312 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  46.6 
 
 
302 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  47.1 
 
 
301 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  42.76 
 
 
312 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  43.14 
 
 
308 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  43.14 
 
 
308 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  42.47 
 
 
308 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  47.49 
 
 
311 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  46.78 
 
 
311 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  47.49 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  47.49 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  47.04 
 
 
311 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  46.62 
 
 
324 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  42.57 
 
 
303 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  41.89 
 
 
303 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  40.64 
 
 
305 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  38.67 
 
 
310 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  40.55 
 
 
304 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  44.6 
 
 
308 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  40.68 
 
 
315 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  40.8 
 
 
321 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  37.59 
 
 
307 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  40.64 
 
 
317 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  43.67 
 
 
272 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  43.67 
 
 
272 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  42.91 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.64 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  36.21 
 
 
307 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  43.85 
 
 
314 aa  172  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  36.76 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  39.8 
 
 
304 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  37.12 
 
 
315 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  39.53 
 
 
314 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  38.18 
 
 
314 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  35.93 
 
 
307 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  35.82 
 
 
297 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  37.41 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  39.86 
 
 
312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  26.56 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.41 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  31.34 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  28 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  25.72 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.24 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  30.58 
 
 
315 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  24.79 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  26 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0609  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.33 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  27.1 
 
 
324 aa  60.1  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26 
 
 
301 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.67 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  26.24 
 
 
283 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  25.33 
 
 
301 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  26.41 
 
 
301 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0525  EamA family protein  25.94 
 
 
316 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  25.33 
 
 
301 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  25.33 
 
 
301 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  25.33 
 
 
301 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  25.33 
 
 
301 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0398  EamA family protein  24.69 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0389  DMT family permease  24.69 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.45 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0411  eama family protein  24.69 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  30.56 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0476  transporter, EamA family  26.23 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0456  transporter, EamA family  24.69 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0386  DMT family permease  24.69 
 
 
316 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00214072  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  26.3 
 
 
286 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0398  hypothetical protein  23.29 
 
 
316 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  30.96 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  25.86 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2607  hypothetical protein  30.07 
 
 
295 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25 
 
 
303 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25 
 
 
303 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  23.32 
 
 
311 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  28.1 
 
 
336 aa  56.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 
291 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4847  transporter, EamA family  24.58 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25.25 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.85 
 
 
349 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  26.58 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  24.67 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.74 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 
317 aa  53.9  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  28.57 
 
 
328 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>