More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0515 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  68.87 
 
 		 324 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  47.84 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.84 
 
 		 301 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.51 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  45.97 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.78 
 
 		 299 aa  218  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  45.54 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.88 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  40.59 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  41.06 
 
 		 305 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  45.97 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  49.45 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  42.41 
 
 		 303 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  40.67 
 
 		 317 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  42.07 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  42.47 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  42.47 
 
 		 376 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  42.09 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  43.15 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  41.75 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.91 
 
 		 307 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.96 
 
 		 293 aa  189  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  42.12 
 
 		 426 aa  188  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  40.07 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  40.8 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  38.6 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  38.6 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  44.52 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  40.07 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  40.07 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  44.1 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  43.24 
 
 		 311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  39.37 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  38.62 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  42.81 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  42.81 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  42.81 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  39.74 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  41.45 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  41.61 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  43.15 
 
 		 272 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  43.15 
 
 		 272 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  37.32 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  37.33 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  37.63 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  36.91 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  38.46 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  37.82 
 
 		 314 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  36.6 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  37.92 
 
 		 297 aa  125  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  33.22 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.12 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.86 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  26.21 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.79 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12940  membrane protein  23.97 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000993304  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  27.63 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  26.9 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  26.21 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  33.18 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  26.21 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  30.47 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  27.27 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  29.6 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  31.3 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  30.04 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.86 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  25.86 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  25.86 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25.51 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.94 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  25.93 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  27.85 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  32.86 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25.6 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  25.94 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  30.74 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  30.74 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  28.66 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  29.39 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  32.06 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  32.06 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  23.19 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.13 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  30.21 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  31.3 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  31.3 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  31.3 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.61 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  24.15 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  31.3 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  29.93 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  29.37 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  32.75 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>