More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4020 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  100 
 
 		 330 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  90.65 
 
 		 311 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  73.33 
 
 		 303 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  67.63 
 
 		 426 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  69.55 
 
 		 376 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  69.77 
 
 		 312 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  72.46 
 
 		 311 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  70.1 
 
 		 312 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  74.83 
 
 		 311 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  71.48 
 
 		 311 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  71.8 
 
 		 311 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  71.8 
 
 		 311 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  64.03 
 
 		 301 aa  342  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  61.39 
 
 		 301 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.71 
 
 		 301 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.38 
 
 		 301 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  69.76 
 
 		 272 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  69.76 
 
 		 272 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  63.18 
 
 		 301 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  54.22 
 
 		 308 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  53.62 
 
 		 308 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  53.29 
 
 		 308 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  52.96 
 
 		 303 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  52.63 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  52.46 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  52.4 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  49.66 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.32 
 
 		 299 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  50.84 
 
 		 302 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  53.59 
 
 		 314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.17 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  50.67 
 
 		 313 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  45.7 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  47.64 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  49.45 
 
 		 299 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  46 
 
 		 305 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  44.15 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  44.05 
 
 		 304 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.55 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  45.54 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  44.75 
 
 		 315 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  39.8 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  42.67 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  47.32 
 
 		 312 aa  189  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  38 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  37.8 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  41.01 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  42.56 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  38.49 
 
 		 314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  39.02 
 
 		 314 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  39.26 
 
 		 297 aa  149  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  30.77 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.62 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  27.63 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0609  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.86 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  31.74 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  29.3 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  27.4 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  30.47 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  29.87 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  28.48 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 		 324 aa  67  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.37 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 299 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  30.33 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  32.75 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  31.96 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  26.64 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  29.08 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  29.33 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  26.46 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.74 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  27.68 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.33 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.13 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 314 aa  62  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  27.46 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  29.08 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  24.75 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  26.44 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  28.47 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  26.99 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.24 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  26.99 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  27.03 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  26.99 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  26.99 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  26.79 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  32.72 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  32.72 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>